El lugar para empezar, quizás, es aquí:
http://www.logicmatters.net/resources/pdfs/TeachYourselfLogic9-2.pdf
Se trata de una guía detallada y comentada de una amplia gama de literatura lógica, con diferentes niveles de sofisticación. Podrá elegir los puntos de entrada que se adapten a su formación.
Sobre la lógica no paraconsistente, véase en particular
http://plato.stanford.edu/entries/logic-paraconsistent/
que ofrece referencias a la literatura. En cuanto a la computabilidad, hay mucho que decir de Boolos, Burgess y Jeffrey,
http://www.amazon.co.uk/Computability-Logic-George-S-Boolos/dp/0521701465
No estoy seguro de lo que se entiende por "lógicas infundadas". Para la teoría de conjuntos no bien fundada, véase
http://plato.stanford.edu/entries/nonwellfounded-set-theory/
que, de nuevo, ofrece más indicaciones. En cuanto a la teoría de los topos, sigo pensando que vale la pena empezar con el libro de Robert Goldblatt:
http://www.amazon.co.uk/Topoi-Categorial-Analysis-Logic-Mathematics/dp/0486450260