7 votos

Química computacional: cálculo de los efectos estéricos

¿Hay alguna forma de calcular las fuerzas estéricas entre átomos/grupos de átomos (preferiblemente con herramientas gratuitas y de código abierto)? He oído que esto es posible en el marco de NBO. Estoy utilizando ORCA, nwchem y Gaussian09 principalmente. Los estéricos son obviamente uno de los aspectos más importantes de la química orgánica, pero aún así no he podido encontrar casi ningún recurso sobre los aspectos de la química computacional. Sería bueno tener una manera de cuantificar los estéricos y también visualizarlos de alguna manera.

¿Alguien tiene alguna experiencia al respecto?

1 votos

Acabo de hacer una búsqueda superficial y me he encontrado con dx.doi.org/10.1063/1.3555760 en los cálculos del efecto anomérico. No estoy seguro de si los puntos de referencia en lo que tenía en mente.

1 votos

¿Y si utilizamos el QTAIM de Bader? Hay algunos la literatura en este sentido.

6voto

Edward Hyde Puntos 209

Creo que estás buscando interacciones no covalentes; si es así, aquí tienes el enlace habitual de Wikipedia, https://en.wikipedia.org/wiki/Non-covalent_interactions

Pero lo más importante es que aquí está el documento que describe el software, http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/ja100936w y aquí está el blog del profesor Rzepa con la "interacción no covalente" buscada, http://www.ch.imperial.ac.uk/rzepa/blog/?s=non-covalent+interacción

Ese es el comienzo, vuelve a postear cuando quieras saber cómo implementarlo.

0 votos

Enlaces útiles, gracias : ) Pero no me refiero a las interacciones no covalentes más amplias, sino a la repulsión estérica. Y he visto algunos documentos que describen "nuevos algoritmos" cómo lograr eso, pero estoy buscando un software ya existente .

1 votos

Parece que un paquete de software llamado NBO 5.9 lo hará. De nuevo del blog del profesor Rzepa, ch.imperial.ac.uk/rzepa/blog/?p=1887#comment-4793 ... afortunadamente esta vez.

0 votos

Sin embargo, NBO 5.9 es propietario (y probablemente también muy caro), sé que existe la alternativa de código abierto JANLA, pero no he podido encontrar información sobre si esto incluye también a los estéricos. ¿Alguien ha utilizado JANLA?

1voto

Amit Puntos 133

¿Y si utilizamos el QTAIM de Bader?

Hay algunos la literatura en este sentido.

i-Ciencias.com

I-Ciencias es una comunidad de estudiantes y amantes de la ciencia en la que puedes resolver tus problemas y dudas.
Puedes consultar las preguntas de otros usuarios, hacer tus propias preguntas o resolver las de los demás.

Powered by:

X