Sugerencia: $\;F_n = F_{n-1}^2 - 2 \iff \dfrac{F_n}{2} = 2 \left(\dfrac{F_{n-1}}{2}\right)^2 - 1\,$, entonces creo que de $\cos 2a = 2 \cos^2 a - 1$.
[ EDITAR ] Vamos a $\,\dfrac{F_n}{2}=\cos a_n\,$, la recurrencia da $\,\cos a_n = 2 \cos^2 a_{n-1} - 1 = \cos 2 a_{n-1}\,$ a que la solución de$\,a_n = 2 a_{n-1}\,$. Por telescópica de la GP $\,a_n = 2^{n-1} a_1\,$, e $\,a_1=\arccos \dfrac{x}{2}\,$ a partir de la condición inicial $\,F_1 = x\,$, así que al final,$\,F_n(x) = 2 \cos \left(2^{n-1} \arccos\left(\dfrac{x}{2}\right)\right)\,$.
Lo anterior funciona para $\,|x| \le 2\,$, en los otros casos, es necesario recurrir a las funciones hiperbólicas como se hace para el trigonométricas definición de los polinomios de Chebyshev, que están de hecho relacionados con su $\,F_n\,$ por la relación $\,F_n(2x) = 2 T_{2^{n-1}}\left(x\right)\,$.