Estoy analizando algunos datos de un experimento. Hay una variable de respuesta (respuesta) y 3 del factor de variables, cada una con 2 niveles (perfil, drogas, enfermedad). Quiero comparar combinaciones específicas de (perfil, drogas,enfermedad), por ejemplo, (perfil 1, las 1, no la enfermedad) vs (perfil 1, las 2, no la enfermedad). Me he ido acercando a este problema como si se tratara de un ANOVA de diseño, pero me he encontrado con algunos problemas al intentar hacer las comparaciones específicas quiero.
Inicialmente probé este análisis en R, pero no podía encontrar ninguna información sobre cómo hacer contrastes con un 3-way ANOVA de diseño. Ahora estoy usando el programa Stata, que es sólo un poco más amigable para el usuario, pero incluso eso me está dando algunos problemas.
Así que lo que he intentado hacer es escribir algo de código para convertir mi factor de diferentes variables en un factor variable con más niveles. Así que en lugar de (perfil, drogas, enfermedad) hemos perfil:drogas:la enfermedad de E. g., perfil1:drug1:disease1 y perfil2:drug1:disease1 son diferentes niveles de un mismo factor variable (llamada newFactor).
Así que puedo ejecutar mi análisis de ANOVA de una vía en newFactor (en R, esto sería aov(respuesta ~ newFactor) y, a continuación, utilizar contrastes de hacer comparaciones entre, por ejemplo, perfil1:drug1:disease1 y perfil1:drug2:disease1? ¿Hay cualquier cosa mal con este enfoque, estadísticamente hablando?
Lo siento por la pregunta larga, y gracias de antemano por su ayuda.
tl;dr versión: quiero convertir un 3-way ANOVA a 1-way ANOVA por agrupar todos mis factor de variables en un nuevo factor, de modo que fácilmente se puede utilizar contrastes.
