Ya hay algunos excelentes respuestas aquí, pero permítanme añadir algo un poco diferente punto de vista.
Primero de todo, homomorphism no es una palabra que puede ser utilizado abiertamente (por así decirlo) en matemáticas. Es una función entre dos estructuras que conserva su estructura, en algún sentido, y este sentido ha de ser especificado como parte de la teoría de las estructuras. (E. g. en la teoría de grupos, definimos el grupo de homomorphisms; en la teoría de anillos, definimos anillo homomorphisms, etc.)
También, en ciertos contextos, no se puede competir nociones de homomorphisms (para anillos con identidad, debe el homomorphisms preservar la identidad?; para espacios de Banach, debe morfismos ser simplemente continua, o deben preservar la norma?); en cualquier situación particular, si aún no está claro en el contexto, se tiene que especificar que la definición que usted está utilizando.
Ahora, en algunas situaciones, nosotros no uso la palabra homomorphism; por ejemplo, no hablamos de un homomorphism de espacios topológicos (en su lugar, hemos continua mapas entre espacios topológicos). La opción de si o no el uso de la palabra homomorphism es en cierta medida, dictada por la tradición, y también por la matemática general de la cultura; la más algebraica de las estructuras bajo consideración son, más probable es que la palabra homomorphism es para ser utilizado con respecto a ellos.
Ahora la categoría de la teoría de los resúmenes de la noción de estructura matemática y la estructura de la preservación de los mapas entre ellos. Como ya se ha señalado en otras respuestas, no todas las categorías son de hormigón, o, incluso si lo son, no son, naturalmente, pensar como el hormigón. Y si estamos hablando de una categoría arbitraria, no se especifica qué tipo de objetos los objetos son en realidad; acabamos de escribir $\mathcal C$, e $x \in\operatorname{Ob}\, \mathcal C$, e $f: x \to y$, sin especificar lo $\mathcal C$ es (como en los teoremas de una teoría de grupo de texto, no se especifica lo que el grupo $G$ es o lo que elementos de la $x$ son o lo que su funcionamiento es; que es solamente un resumen, el grupo no especificado).
Ahora los fundadores de la categoría teoría, sabían que eran la abstracción de una situación en la que muy a menudo la categoría a la que iba a consistir de estructuras algebraicas y homomorphisms entre ellos. Pero también sabían que eran la abstracción de los ejemplos de espacios topológicos y continua de los mapas, donde homomorphism es no el término tradicional. Por lo tanto, se eligió morfismos como estar lo suficientemente cerca como para homomorphism a ser sugerente, pero no idénticos, de manera que no dé la impresión psicológica de descartar contextos como espacios topológicos y continua de los mapas. [Este último párrafo es de mi invención, no la real de la historia, pero que es probablemente muy cerca de la real de la historia, y esperemos que obtiene el punto a través.]
Finalmente, cabe señalar que, a menudo, ahora en matemáticas de la gente habla de un morfismos de anillos o grupos o ..., es decir, colocar el prefijo homo-, y creo que esta es la influencia de la categoría general de la teoría de la terminología.