¿Prueba exacta de Fisher con ceros en los datos?

Question

Tengo una pregunta sobre la realización de pruebas de independencia para datos categóricos con la Exacta de Fisher cuando tengo ceros en mis datos. Dado que no he observado datos para una categoría en ambos grupos, ¿es correcto incluir el cero? ¿Es lo mejor que puedo hacer con algunas categorías vacías?

Por ejemplo, el siguiente código R representa mis dos grupos de 7 categorías:

v1 <- c(31, 9, 6, 0, 5, 0 27)
v2 <- c(13, 0, 1, 0, 1, 2, 7)
v <- cbind(v1, v2)
fisher.test(v)
p-value = 0.08061

Answer 1

Una fila (o columna) de $0$ en una prueba de Fisher no aportan nada al cálculo (no debería cambiar las probabilidades de las distintas tablas con los mismos márgenes que la tabla de muestra si se eliminan dichas filas y/o columnas).

Como resultado, no debería haber ninguna diferencia, pero personalmente yo los eliminaría (puede ayudar a evitar una serie de posibles problemas, incluyendo los programas que podrían negarse a un tamaño de tabla en particular, pero no a uno un poco más pequeño).