Cómo elegir la prueba estadística para la prueba de permutación?

Question

Es el propósito de la prueba de permutación para probar el valor null que varios grupos de muestras provienen de la misma distribución?

He encontrado sus pasos son

Los pasos en una permutación basado en el cálculo del nivel de significación de un estadístico de prueba es la siguiente:

i) Elegir un estadístico de prueba, por ejemplo. un t-score para una comparación de los dos grupos,

ii) Calcular el estadístico de prueba para el gen de interés,

iii) Permutar en las etiquetas de las muestras al azar, y volver a calcular el estadístico de prueba para el reordenado las etiquetas; repita el procedimiento para un gran número de (quizás 1.000) de permutaciones, y, finalmente,

iv) Calcular la fracción de casos en los que la estadística de prueba de iii) superar la prueba real de la estadística de ii).

¿Qué tipo de prueba estadística se debe elegir en el primer paso?

En el ejemplo se utiliza el t-score, que mide la diferencia entre los dos grupos. Pero a mí me parece que cualquier estadística de trabajo, no necesariamente la medición de la diferencia entre los dos grupos. Es correcto?

Gracias y saludos!

Answer 1

A menudo hay varias estadísticas que todos los resultados en el mismo valor de p/resultado. Por ejemplo, en un 2 muestra el caso de que la diferencia de los 2 medios, la media del grupo a, y la suma de los valores en el grupo a todos como resultado el mismo valor de p (esto es debido a que dado los valores de los datos y los tamaños de muestra se puede calcular la 1 de 2 puesto que sólo la 3ª). Yo esperaría que la t estadística a ser similares a los de cualquier de los de arriba, pero puede no ser exactamente la misma (debido a los dividiendo por la desviación estándar(s)). Hay otras estadísticas que pueden ser muy diferentes en los resultados, posiblemente la diferencia de los 2 medianas, o la relación de 2 desviaciones. Estas estadísticas serán afectados en forma diferente por la permutación proceso.

Su elección debe basarse en una combinación de lo más interesante basado en la ciencia y la pregunta (a veces en los camellones pueden ser de más interés, otras veces significa que podría ser) y lo que les dará el poder para detectar una diferencia en la razonable/alternativas importantes. Usted puede probar esto más adelante mediante la simulación de los datos de los casos que usted piensa que es probable o muy interesante, y viendo cómo las estadísticas de realizar.

Answer 2

Elige un estadístico de prueba que mide lo que usted está interesado en/tiene las propiedades que se necesitan.

Si quieres comparar significa que la base de las diferencias de los medios; si quieres un robusto comparación de la ubicación, puede medir algo más; si desea comparar las desviaciones estándar, se utiliza una estadística que hace eso; si quieres comparar todos los aspectos de las distribuciones que usted utilice una estadística que compara todos los aspectos (tales como k-muestra la versión de la prueba de Kolmogorov-Smirnov, para un ejemplo).