En la primera Exposición de SGA4, justo después de la Definición 2.1, leemos
(1) Para la variable $G,\ \varprojlim G$ es un functor de la categoría $\text{Funct}(I,\mathcal C)$$\widehat{\mathcal C}$.
(En francés: "Pour $G$ variable, $\varprojlim G$ est un foncteur de la categoría $\text{Fonct}(I,\mathcal C)$ à valeurs dans $\widehat{\mathcal C}$.")
Recordemos que $\mathcal U$ es un universo vacío, $\mathcal C$ $\mathcal U$- categoría, $X$ un objeto de $\mathcal C$, $I$ un $\mathcal U$-categoría pequeña, y $\varprojlim G$ está definido por $$ \left(\varprojlim G\right)(X):=\text{Hom}_{\text{Func.}(I,\mathcal C)}(k_X,G). $$ Para encontrar un contraejemplo a (1) es suficiente para encontrar un triple $(\mathcal U,\mathcal C,X)$ donde $\mathcal U$ es un universo, $\mathcal C$ $\mathcal U$- categoría de pequeña y $X$ un objeto de $\mathcal C$ tal que
(2) $\text{End}_{\text{Funct}(\mathcal C,\mathcal C)}(k_X)\notin\mathcal U$.
A mí me parece el siguiente proporciona un contraejemplo.
Deje $\mathcal U$ ser un universo vacío y $X$ un conjunto tal que
(3) $X\notin\mathcal U$,
y definir la categoría de " $\mathcal C$ por $$ \text{Ob}(\mathcal C) :=\{X\}=:\text{End}_{\mathcal C}(X). $$
Tenemos $$ \text{id}_{k_X}\in\text{End}_{\text{Func.}(\mathcal C,\mathcal C)}(k_X)\subconjunto\prod_{Y\in\{X\}}\text{End}_{\mathcal C}(X) $$ $$ =\prod_{Y\in\{X\}}\{X\}= \{\{(X,X)\}\} $$ y así
(4) $\text{End}_{\text{Funct}(\mathcal C,\mathcal C)}(k_X)=\{\{(X,X)\}\}$.
Aquí está una observación general:
(5) Para cualquier conjunto $Y$ tenemos $Y\in\mathcal U$ si y sólo si hay una cadena $$ Y=Y_0\en Y_1\en\cdots\en Y_n=\mathcal U $$ con $n\ge1$.
Ahora (2) se sigue de (3), (4) y (5).
Lo que me estoy perdiendo?