La respuesta depende de a qué te refieres por $\mathrm{Aut}(H^1(S))$. Si te refieres lineal general del grupo, entonces la respuesta es no, pero si te refieres a la simpléctica grupo, entonces la respuesta es sí.
Hay una taza de producto de emparejamiento $H^1(S) \times H^1(S) \to H^2(S) \cong \mathbf Z$ que es simpléctica, y cualquier automorphism de la superficie, se conserva este emparejamiento (hasta un signo, si usted no lo requieren para conservar la orientación de $S$). Esta es la única condición: cualquier simpléctica automorphism puede ser realizado por una homeomorphism de la superficie.
Ver también http://en.wikipedia.org/wiki/Mapping_class_group#Torelli_group