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¿Cómo es el vínculo de la longitud calculada a partir del total de energía electrónica?

En el curso de química cuántica que actualmente asisto, se dijo varias veces que una de las cantidades derivadas de las moléculas por medio de cálculo es el total de energía electrónica $E_\text{el}$, porque a partir de esto muchas cantidades derivadas pueden ser calculados, tales como bonos de longitud o $J$-acoplamiento de valores para los experimentos de RMN.

Sin embargo, nunca he conseguido una buena explicación de cómo proceder cuando he calculado un valor de $E_\text{el}$ y quieres saber las longitudes de enlace en la molécula en cuestión.

¿Cuáles son las fórmulas y/o cálculo de los pasos necesarios para esto?

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Adam Puntos 343

La geometría de un sistema es lo que se conoce (o dados) y una energía correspondiente se calcula. Si usted tiene una energía, entonces usted debe tener la geometría (o en su caso, de los bonos de longitud).

La función de onda, $\Psi$, en el Schrodiner ecuación es simplemente una función de todas las posiciones de las partículas dentro del sistema de núcleos y electrones). Normalmente químicos invocar el Born-Oppenheimer aproximación que se supone que los núcleos son estacionarias (congelado en el espacio) con respecto a la "fast-moving' electrones. Por lo tanto, se congelan los núcleos en el espacio y calcular la energía de este estado estacionario. Mover los núcleos en su molécula un poco y se obtendrá una nueva energía.

Como Wildcat estaba explicando, la optimización de los procedimientos esencialmente mueve los núcleos en su molécula alrededor en el espacio, la informática, la energía para cada configuración. El objetivo de este tipo de rutina es encontrar una energía que es más bajo que el resto. Tomemos, por ejemplo, el $\ce{H2}$ molécula. Contiene uno de los bonos de longitud y por lo tanto la única coordinar debemos considerar en un 'procedimiento de optimización' es la separación internuclear de los dos $\ce{H}$ átomos. Es el químico que se elija la posición inicial de estos átomos. Decir que inicialmente el conjunto de estos átomos a 200 pm de distancia. Se calcula una energía. Ahora bien, ¿podemos hacerlo mejor? (es decir, podemos perturbar esta geometría, de tal manera que da lugar a una menor energía?) Bien sin duda podemos intentar otras longitudes de enlace así que ahora el conjunto de nuestros bonos de longitud a 150 pm y calcular una nueva energía. He aquí podemos ver que esta nueva energía es menor que el primero! Seguimos tratando de diferentes longitudes de enlace hasta que llegamos a un punto donde la energía aumenta , no importa lo que hacemos con la separación (si se aumenta o disminuye). Una vez que estamos en este punto, hemos encontrado la energía más baja de configuración de $\ce{H2}$. Por supuesto, la optimización de las rutinas son más inteligente que hacer un ataque de fuerza bruta enfoque de muestreo de todas las posibles cantidades cada geométrica de parámetro puede tomar. Por otra parte, la segunda derivados son esenciales para la caracterización de la naturaleza del estado estacionario que se determinó (es decir, el estado estacionario de un cierto mínimo, un estado de transición o de un orden superior de punto de silla?).

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Swinders Puntos 1042

No hay una fórmula. En resumen, para un estado electrónico de interés hacer lo que se conoce como la geometría de la optimización, es decir, el elegido electrónica del estado a resolver la electrónica, de la ecuación de Schrödinger para un número fijo (o sujeta) nuclear configuración elegida en cierta manera por el empleado de minimización de procedimiento con el fin de encontrar el mínimo de la energía electrónica. Y la central nuclear de configuración que corresponde al mínimo de la energía electrónica para el elegido electrónica del estado describe el equilibrio de la geometría de una molécula que es en la opción de electrónica del estado. Luego de equilibrio nuclear de configuración usted puede extraer fácilmente los parámetros estructurales, tales como, por ejemplo, longitudes de enlace.

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Seb Puntos 5120

La forma tradicional de obtener el derecho de la geometría de su sistema es un fijo de la estructura atómica, realizar una estructura electrónica de minimización, calcular las fuerzas que actúan sobre los átomos de que, los utilizan para alterar la estructura atómica de acuerdo a las fuerzas y, a continuación, utilizar la alteración de la estructura que empezar de nuevo. Esto se repite hasta que convergen al equilibrio de la geometría.

Sin embargo, hay una alternativa (muy elegante) en el camino de la DFT cálculos utilizando pseudopotentials o la PATA método con el avión de onda base fija: el ab-initio de dinámica molecular método presentado por Roberto Coche y Michele Parrinello. El "killer feature" de la Car-Parrinello método es que permite la solución simultánea de la estructura electrónica y el problema de las ecuaciones de movimiento para los núcleos que permite la relajación de los núcleos para encontrar estructuras estables, es decir, el equilibrio de la geometría, así como para las simulaciones térmicas de los sólidos y líquidos, por lo que este método no ofrecen mucho más que una simple optimización de geometría. ¿Cómo se logra? En el Car-Parrinello enfoque, el total de Kohn-Sham (KS) la energía es la energía potencial como función de la posición de los núcleos. Las fuerzas de esta energía, a continuación, determinar la dinámica molecular (MD) de los núcleos. La característica especial de la Car-Parrinello algoritmo es que también se resuelve el quantum problema electrónico con MD. Esto se logra mediante la derivación de las ecuaciones de movimiento de una ficticia de Lagrange , que contiene una ficticia de la energía cinética de la electrónica (KS) las funciones de onda y algunas restricciones para garantizar que las funciones de onda permanecer ortonormales:

\begin{align} \mathcal{L} &= \sum_{n} f_{n} m_{\psi} \langle \dot{\psi}_{n} | \dot{\psi}_{n} \rangle + \frac{1}{2} \sum_{i} M_{i} \dot{\vec{R}}_{i} \! {}^{2} + E_{\mathrm{DFT}}[\psi_{n}, \vec{R}_{i}] - \sum_{m, n} \Lambda_{n,m} \left( \langle \psi_{m} | \psi_{n} \rangle - \delta_{n,m} \right) \end{align}

donde $f_{n}$ es la ocupación de la $n^{\mathrm{th}}$ Kohn-Sham eigenstate $\psi_{n}$, $M_{i}$ y $\vec{R}_{i}$ son la masa y la posición de la $i^{\mathrm{th}}$ núcleo, $\delta_{n,m} = \begin{cases}1 & n=m \\ 0 & n \neq m \end{cases}$ es la delta de Kronecker, $\dot{\psi}_{n} = \frac{\mathrm{d} \psi_{n}}{\mathrm{d}t}$ $\dot{\vec{R}}_{i} = \frac{\mathrm{d} \vec{R}_{i}}{\mathrm{d}t}$ son las primeras derivadas con respecto al tiempo y $\Lambda_{n,m}$ es un multiplicador de Lagrange asegurar la restricción de la función de onda orthonormality. El primer término de esta Lagrange representa el ficticio de la energía cinética de las funciones de onda. No hay ninguna correspondencia física para este término. Lo ideal sería de elegir el ficticio masa $m_{\psi}$ de las funciones de onda igual a cero. Esta introducción de este no físico cantidad también conducir a la nomenclatura de la Lagrangiana ficticios. El segundo término describe la clásica, la energía cinética de los núcleos. El tercer término $E_{\mathrm{DFT}}[\psi_{n}, \vec{R}_{i}]$ es el funcional de la densidad total de energía, que es un funcional de la electrónica de las funciones de onda y las posiciones atómicas. El último término es la restricción de ortonormales funciones de onda $| \psi_{n} \rangle$. Aplicando el principio de la menor acción para este Lagrangiano conduce a la siguiente Euler-Lagrange las ecuaciones (ecuaciones de movimiento para el ab initio MD simulación):

\begin{align} M_{i} \ddot{\vec{R}}_{i} &= \underbrace{- \nabla_{\vec{R}_{i}} E_{\mathrm{DFT}}}_{= \, \vec{F}_{i}} \\ m_{\psi} | \ddot{\psi}_{n} \rangle &= - \underbrace{ \frac{1}{f_{n}} \frac{\delta E_{\mathrm{DFT}}}{\delta \langle \psi_{n} |} }_{= \, \hat{H} | \psi_{n} \rangle } + \underbrace{ \sum_{m} | \psi_{m} \rangle \frac{\Lambda_{n,m}}{f_{n}} }_{\tilde \, | \psi_{n} \rangle \epsilon_{n}} \end{align}

donde $\ddot{\psi}_{n} = \frac{\mathrm{d}^{2} \psi_{n}}{\mathrm{d}t^{2}}$ $\ddot{\vec{R}}_{i} = \frac{\mathrm{d}^{2} \vec{R}_{i}}{\mathrm{d}t^{2}}$ son las segundas derivadas con respecto al tiempo, $\hat{H}$ es el Kohn-Sham hamiltonianos, $\epsilon_{n}$ $n^{\mathrm{th}}$ Kohn-Sham autovalor y $\vec{F}_{i}$ es la fuerza que actúa sobre el $i^{\mathrm{th}}$ núcleo. El primer conjunto de ecuaciones se acaba de Newton, las ecuaciones de movimiento para los núcleos que se mueve debajo de la fuerzas derivadas de $E_{\mathrm{DFT}}$.

La solución estacionaria en el segundo conjunto de ecuaciones es equivalente a la de Kohn-Sham ecuaciones, ya que para un estado estacionario de todos los tiempos derivados de desaparecer, de modo que:

\begin{align} \hat{H} | \psi_{n} \rangle &= \sum_{m} | \psi_{m} \rangle \frac{\Lambda_{n,m}}{f_{n}} \end{align}

La construcción de una matriz de $\mathbf{\Lambda}$ a partir de los multiplicadores de Lagrange $\Lambda_{n,m}$ muestra que $\mathbf{\Lambda}$ es proporcional a la transpuesta de la matriz de representación de $\hat{H}$, es decir,$\Lambda_{n,m} \propto H_{m,n}$. Diagonalizing $\mathbf{\Lambda}$ conduce a los autovalores $\epsilon_{n}$ de la Kohn-Sham ecuaciones. Así, este Lagrangiano no conduzca a la vez dependiente de la ecuación de Schroedinger para la electrónica de las funciones de onda. Más bien se crea una dinámica que (en el caso ideal) mantiene a los electrones siempre en su estado fundamental.

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