¿ANOVA o test de la t?

Question

Estoy tratando de comparar las diferencias en los sitios y años relacionados con las variables ambientales. Por ejemplo, hay una diferencia significativa en la concentración de clorofila (chlo) a través de los años (desde 2002-08)? O es que hay una diferencia en la concentración de clorofila entre Seychelles, Indonesia y Brasil? He empezado a utilizar un ANOVA, pero estoy recibiendo bastante extraño resultados, de ahí mi consulta: que stat prueba sería mejor utilizar para el siguiente conjunto de resultados:

Year     Site     Chlo    DAC   PARD    SST
2003     Seych    2.95   0.24 -39.36   0.40
2003     Brazil  -2.35  -0.14  22.97   4.03
2003     Indo     0.42   0.04   6.82   0.60
2004     Seych    0.20   0.02  -2.30  -0.63
2004     Brazil  -0.22  -0.01 -10.28  -1.22
2004     Indo     0.32   0.03  15.82  -1.72
2005     Seych    0.20   0.02   2.02   0.36
2005     Brazil   0.01   0.00 -11.36   2.86
2005     Indo     0.28   0.03  -2.14   1.90
2006     Seych   -0.05  -0.03  -0.53   0.36
2006     Brazil   2.24   0.13 -22.89  -1.51
2006     Indo     0.41   0.04   3.70  -2.35
2007     Seych   -0.18   0.00  -4.49   3.03
2007     Brazil  -1.04  -0.06   8.85  -0.04
2007     Indo     0.15   0.01  -4.55   0.54
2008     Seych   -0.64  -0.05  11.52  -4.20
2008     Brazil  -0.26  -0.01   5.65   0.24
2008     Indo    -0.12   0.00 -16.04  -2.98
2009     Seych   -0.97  -0.09  15.65   2.63
2009     Brazil   2.36   0.14  -7.06   2.46
2009     Indo    -0.54  -0.06  23.97   2.68
2010     Seych   -0.08   0.00  -2.58   1.49 
2010     Brazil   1.20   0.07  -5.91   1.66
2010     Indo    -0.46  -0.04 -22.87   5.62 
2011     Seych   -0.62  -0.04   8.44   0.33
2011     Brazil  -0.13  -0.01  -3.38  -4.57
2011     Indo    -0.11  -0.01 -12.32  -0.54
2012     Seych   -0.81  -0.07  11.64  -2.65
2012     Brazil  -1.80  -0.11  23.42  -3.71
2012     Indo    -0.35  -0.03   7.63  -3.75

He preguntado a una pregunta similar en la esperanza de que voy a recibir una mejor respuesta de los usuarios. Es una forma de ANOVA con la prueba correcta para usar?

Answer 1

La cuestión es simplemente que hay diferencias muy pequeñas en la media en comparación con la variación en los datos. Ninguna de las variables (ni cualquier combinación lineal de ellas) se diferencian mucho sobre el Sitio.

Mi conjetura es que hay una o más variables importantes no en el conjunto de datos que está manejando casi toda la variación en los datos, y sin el control de los mismos (incluyendo como covariables, o bien la representación para ellos) que tienen poca esperanza de recoger las sutiles diferencias entre los sitios, e incluso si el tamaño de la muestra eran lo suficientemente grandes para obtener diferencias significativas, no se podía descartar que simplemente se trataba de una asociación entre dichas variables ocultas y Sitio.

Hay diferencias grandes en todo el Año en algunas variables, pero usted probablemente no quiere dividir en Año, y el Año tiene un efecto, no quieres mirar algo como las diferencias en Chlo en el Sitio solo, dado que hay un efecto Año. Te gustaría Año de uso en un modelo de Sitio en cuestión. No hacerlo reduce la potencia y la invita de la paradoja de Simpson.

Como whuber señala en los comentarios, el Site significa que puede haber sido sacados de las diferentes variables ambientales (aparte de la SST variable):

              Variable means by Site:

           Brazil          Indo         Seych 
Chlo        0.001    -4.163e-18     1.662e-17 
DAC     1.212e-18         0.001    -1.390e-18 
PARD        0.001         0.002         0.001 
SST         0.02       1.11e-17         0.112 

¿Qué está pasando? Algunos de estos ha significa-corregido ya?

Answer 2

Creo que se deben utilizar un medidas repetidas ANOVA, donde el entre tema factor es país y medidas repetidas en el tiempo. Si el entre tema factor es significativo puede utilizar varias pruebas (pruebas es decir, parejas con ajuste del error alfa) para determinar entre qué países se producen mayores diferencias.