La respuesta a esto depende de cómo los reactivos se mezclan. Por una parte, usted puede tener la reacción sin agua, como se ha señalado por @Klaus en los comentarios. Si el golpe seco de HCl en seco NaOH, que va a reaccionar sin que entre agua en los reactivos.
$$\ce{HCl + NaOH -> H2O + NaCl}$$
Probablemente este no sea el caso, y si usted está tratando con soluciones, entonces sí, el agua va a reaccionar. Si empieza por la adición de HCl al agua pura, tendrás
$$\ce{HCl + H2O -> H3O+ + Cl-}$$
Esta representación es preferida sobre la simple disociación $\ce{HCl -> H+ + Cl-}$ porque demuestra que no tiene "libre" de los protones en la solución. En realidad se podría incluso decir que esta reacción ya ha sucedido, ya que, teniendo en cuenta que usted está usando ácido clorhídrico es ya disuelto, y este paso sólo sería una dilución.
Si usted comienza con la solución de NaOH, se podría argumentar que el agua no reaccionar ya
$$\ce{NaOH -> Na+ + OH-}$$
pero eso sólo ocurre en el estado líquido (generalmente en solución). También, usted no puede ignorar la solvatación de los iones (que es uno, si no el factor más importante que afecta a la solubilidad del hidróxido de sodio de la sal) y el equilibrio
$$\ce{H2O + OH- <=> OH- + H2O}$$
Y lo que esto significa es que usted no tiene fijo hydroxil los iones y las moléculas de agua, así que usted no puede simplemente ignorar el disolvente y asumir que es sólo un espectador de la molécula de espera de alrededor.
Escribir la reacción de dos pasos, no es una buena idea para hacerlo en una sola línea, porque como se puede ver en el primer paso de NaOH en ambos lados, que es algo que no tiene mucho sentido. Es mejor hacerlo así:
$$\ce{HCl + H2O -> H3O+ + Cl-}$$
$$\ce{H3O+ + Cl- + NaOH -> 2H2O + NaCl}$$
Normalmente es una buena idea para representar sales en su forma iónica, cuando se disuelve, lo que sería
$$\ce{H3O+ + Cl- + NaOH -> 2H2O + Na+_{(aq)} + Cl^{-}_{(aq})}$$
