TL;DR: El agua es increíblemente fácil de obtener y trabajar.
En detalle
El agua es un buen disolvente para compuestos polares[se necesita cita], y las razones para esto están bastante bien explicadas por John Snow, pero eso no es realmente lo que lo convierte en el disolvente universal.
En cambio, una serie de otras propiedades incidentales lo convierten en una opción popular:
Disponibilidad
Hay mucho agua[se necesita cita]. Literlamente cae del cielo. Esto significa que para la mayoría de las aplicaciones, es el disolvente más barato disponible.
Reactividad
El agua es una molécula bastante estable. Pocas cosas que puedas disolver en agua se espera que reaccionen significativamente con ella. No arderá ni se comburirá fácilmente, incluso en forma de vapor, y su alta capacidad calorífica y prevalencia (ver arriba) significa que puede apagar efectivamente la mayoría de las reacciones descontroladas que puedan ocurrir, como incendios (hay momentos en los que agregar agua a un fuego es una mala idea, especialmente quizás en un laboratorio, pero incluso en esos momentos el problema se puede resolver agregando mucho agua).
Toxicidad
A diferencia de otros disolventes comunes, el agua no es tóxica[se necesita cita], y no es un peligro bio- o ecológico. Esto significa que el disolvente no utilizado se puede desechar sin precauciones especiales, y si el soluto se puede desechar trivialmente, el disolvente también se puede desechar.
Pureza y estabilidad
El agua está en todas partes[se necesita cita], lo que le da otra propiedad única: A diferencia de muchos otros disolventes, el agua no absorberá el vapor de agua atmosférico, disminuyendo su pureza como una cuestión natural. (Todavía intercambiará agua con el vapor atmosférico, por supuesto, pero no cambia significativamente su composición.)
El agua destilada al 100 % permanecerá más o menos pura a menos que algo se le agregue activamente, lo cual, aunque no es único, es útil y algo poco común. Las moléculas de agua tampoco se descompondrán espontáneamente bajo la mayoría de las condiciones racionales.
Temperaturas de operación
El agua es líquida en un amplio rango de temperaturas, desde 0°C hasta 100°C. En condiciones de laboratorio de ~1 atm y 20-25°C, el agua es un líquido práctico y bien comportado.
Además, mientras que la fase líquida está disponible en un amplio rango de temperaturas, los estados sólido y gaseoso no están fuera de alcance al utilizar incluso equipos extremadamente básicos. Enfriar el agua a mucho menos que 0°C, digamos -18°C, o hervirla, son actividades triviales, utilizando equipos que no solo están disponibles en cada laboratorio, sino incluso en la mayoría de los hogares.
En resumen...
El agua no siempre es la mejor herramienta para el trabajo, pero casi siempre es buena o excelente, al menos cuando se trabaja con compuestos polares. Una alternativa común al agua es el alcohol etílico, que tiene propiedades polares y temperaturas de operación similares, pero el etanol tiene debilidades en las otras categorías mencionadas aquí, es decir, su reactividad, su absorción de vapor de agua y su precio.