Los enlaces químicos se forman cuando atómicos orbitales de los núcleos que se van a unir interactuar y formar un orbital molecular.
El caso más simple de la formación del enlace es la formación de dihidrógeno ($\mathrm{H_2}$) de 2 átomos de hidrógeno. El último tiene (en el estado fundamental) de cada uno de los electrones en un $1s$ atómico orbital y estos orbitales, a continuación, se combinan en una $\sigma$ orbital molecular, ver esquema a continuación:
Lo más destacable es que el nivel de energía de la $\sigma$ orbital es menor que la de la $1s$ orbital. Por supuesto, eso significa que la energía que se libera cuando los enlaces de hidrógeno (dihidrógeno) formas.
Para resumir, los enlaces químicos no son realmente de la materia, sino que pequeñas cantidades de la materia convertir a la energía cuando se forman.
Y debido a la masa-energía de equivalencia esto también significa que una muy, muy pequeña cantidad de la materia se convierte en energía. Las entalpías de enlace de $\mathrm{H_2}$ es de alrededor de $-435\:\mathrm{kJ/mol}$ ($\mathrm{mol}$ de hidrógeno es de alrededor de $2\:\mathrm{g}$), por lo que puede trabajar el tema desaparece, aunque!
Para resumir, los enlaces químicos no están hechas de materia, sino de pequeñas cantidades de la materia convertir a la energía cuando los enlaces químicos formulario.