¿Existe algún repositorio de datos de compuesto químico que le da la estructura de los compuestos con la ayuda de la geometría de coordenadas. Sería como si cada átomo tiene una coordenada y de la lista de los bonos que tiene con otros átomos, de modo que la estructura 3D del compuesto puede ser creado a partir de esta descripción teórica?
Respuestas
¿Demasiados anuncios?No estoy del todo claro en lo que quiere - supongo que una base de datos de un montón de coordenadas 3D para muchos compuestos orgánicos?
Por mucho, la más grande base de datos NIH PubChem con más de 30 millones de compuestos en su mayoría orgánicos. Usted puede buscar por la estructura o el nombre o identificador. La mayoría de estos han 2D y 3D geometrías puede visualizar o descargar y muchos calculan propiedades.
Una base de datos similar es la RSC ChemSpider con más de 34 millones de compuestos. Mucho como PubChem, nombres, 2D y 3D de las geometrías y de otras propiedades disponibles.
Voy a poner en un enchufe para el Pitt Cuántica Repositorio que contiene ~64,000 moléculas y creciente, todas con geometrías calculadas utilizando los métodos de la química cuántica. Uno de los beneficios de PQR es que usted puede fácilmente acceder al sitio utilizando smartphones y tablets y el uso de un código QR o DOI al enlace para el compuesto.
Una muy buena base de datos de los datos experimentales compilado en un solo lugar, tiene una sección de geometría. Echa un vistazo http://cccbdb.nist.gov/
Ir a los datos experimentales de la sección, a continuación, haga clic en resumen de la geometría de datos para una molécula. La base de datos es bastante grande, pero no todas las moléculas tienen una completa geométrica del conjunto de datos.