Por lo general, $f$ y $f(x)$ se utilizan indistintamente. Pero rigurosamente deberían ser utilizados de la siguiente manera.
La letra única $f$ denota la función, es decir, la máquina en la que puede insertar un valor y obtener otro valor. Sí, esto puede ser confuso al principio, porque está acostumbrado a usar letras únicas para variables. Sin embargo, las variables pueden ser de todo tipo. Hay números, letras, valores de verdad, ..., y funciones. Las funciones son simplemente otro tipo posible de variables. El hecho de que $f$ sea una función debe indicarse en algún lugar del texto antes de que se utilice. Por ejemplo, así:
Sea $f:A\to B$ una función. Entonces $f$ es ...
Después de esta línea solo tienes que recordar que es una función. En contraste, $f(x)$ denota el valor de $f$ al insertar $x$ como argumento de la función. Por lo general, $f(x)$ no es una función, sino lo que sea que $f$ devuelva (por ejemplo, un número real).
Ejemplo. Sea $f:\Bbb R\to\Bbb R$ una función definida por $f(x)=x^2$.
Entonces $f$ denota el "proceso de elevar al cuadrado", mientras que $f(x)$ es simplemente otra forma de escribir $x^2$, y $f(2)$ es simplemente otra forma de escribir $4$. Además, la variable utilizada para ser insertada en $f$ no tiene un nombre fijo. Así que $f(s)$ significa $s^2$ y no una función diferente a $f$. Sin embargo, puede ver todo tipo de abuso de esta notación, por ejemplo, denotando la transformada de Laplace de $f$ por $f(s).
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Eso es de analistas para ti. Tienen miedo de usar la notación adecuada.
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Relacionado: math.stackexchange.com/q/6870/1242
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Su profesor no está escribiendo todos los detalles, quizás debido a limitaciones de tiempo. Creo que mucha de la confusión inicial proviene de no distinguir $f$ de $f(x)$, etc. de manera apropiada. Otros abusos se dan con las notaciones para las derivadas.