Es cierto que si tienes una homotopía $F : X \times [0,1] \to Y$ entre $f,g : X \to Y$, entonces para todo $x \in X$ esto define un camino entre $f(x)$ y $g(x)$, dado por $t \mapsto f(x,t)
Este es un enunciado "si... entonces...". La conversa debe ser verdadera. Si te doy un mapa $F : X \times [0,1] \to Y$, y te digo que para todo $x$, $t \mapsto F(x,t)$ es continuo; en otras palabras, te doy una colección de caminos de $f(x)$ a $g(x)$ para todo $x; ¿implica que $F$ en sí es continuo? Por supuesto que no, y es bastante fácil construir contraejemplos.
Hay una forma intuitiva de ver esto para el círculo. Imagina que tu círculo es un reloj. Digamos que quieres encontrar una homotopía entre la identidad y el mapa que es constantemente igual a las 12 en punto (es decir, $i \in S^1 = \{ z \in \mathbb{C} \mid |z| = 1 \}$). Entonces, para cada punto $x$ del círculo tienes que encontrar un camino desde $x$ hasta las 12:00. Ya sea que vayas por la parte izquierda del círculo (en sentido horario), o que vayas por la parte derecha (en sentido antihorario).
Es bastante intuitivo que si tienes un punto justo un poco antes de las 12:00, querrás ir en sentido horario. Y si estás un poco después de las 12:00, querrás ir en sentido antihorario. Dado que quieres que todo este proceso sea continuo, esto se extenderá hasta abajo. Pero, ¿qué hay de las 6 en punto ahora? ¿Cómo eliges entre sentido horario o sentido antihorario? De cualquier manera que elijas, "romperás" el círculo por la mitad, porque un poco a la izquierda o a la derecha estarás yendo en la otra dirección. E intuitivamente, romper cosas por la mitad no es algo continuo.
Esto no es una prueba formal, obviamente. Hay mucha teoría para demostrar realmente que es imposible encontrar una homotopía entre la identidad y un mapa constante, por ejemplo, mostrando que el grupo fundamental del círculo es $\mathbb{Z}$, lo cual no es trivial. Pero esta es la intuición: si tienes que elegir caminos continuamente desde cada $x \in S^1$ hacia un $x_0 \in S^1$ fijo, tendrás que "romper" el círculo por la mitad tarde o temprano, y esto no es continuo.
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Esta es un error lógico básico. Por supuesto, si asumes algo falso, puedes concluir cualquier cosa, por lo tanto, concluir algo verdadero no significa necesariamente que lo que asumiste inicialmente sea verdadero.
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Has demostrado que si $S^1$ es contractible, entonces es conexo. Es cierto, pero ¿y qué?