$\int f(x)\,\mathrm{d}x$ es una antiderivada. Representa cualquier función cuya derivada con respecto a $x$ sea $f(x)$.
$\int_0^af(x)\,\mathrm{d}x$ es una integral definida, y para cualquiera de las antiderivadas $g(x)=\int f(x)\,\mathrm{d}x$ (que incorporan una constante de integración), $$ \int_0^af(x)\,\mathrm{d}x=g(a)-g(0) $$ Por ejemplo, $$ \int x^3\,\mathrm{d}x=\frac14x^4+C $$ para alguna constante $C$, y $$ \begin{align} \int_0^ax^3\,\mathrm{d}x &=\left(\frac14a^4+C\right)-\left(\frac140^4+C\right)\\ &=\frac14a^4 \end{align} $$ sin importar cuál $C$ se elija.
En el caso anterior, $\int_0^xf(x)\,\mathrm{d}x$, hay confusión porque se usa la misma variable dentro de la integral como en los límites. La variable ligada $x$ dentro de la integral no es la misma que la variable libre $x$ en el límite. Para reducir la confusión, tu integral también se puede escribir como $\int_0^xf(t)\,\mathrm{d}t$ cambiando el nombre de la variable ligada. En cualquier caso, esta es una integral definida.