Encontrar grandes bases de datos de empaquetamientos de esferas

Question

Me gustaría disponer de una gran base de datos de empaquetamientos de esferas que pudiera investigar utilizando un programa que he escrito y que me dice ciertas cosas sobre los empaquetamientos. Después de investigar un poco he encontrado algunas bases de datos en línea pero muchas de ellas no han sido cuidadas por lo que están plagadas de enlaces muertos. Me preguntaba si alguien sabe de algún libro o sitio web que tenga muchos embalajes de esferas que pueda investigar. O si hay una manera de interpretar las estructuras cristalinas como un empaquetamiento de esferas, viendo que hay un montón de bases de datos de estructuras cristalinas.

Si alguien está confundido en cuanto a qué tipo de datos estoy buscando, sólo necesito las coordenadas de los centros de las esferas y sus correspondientes radios. Estos necesitan formar un empaquetamiento donde las esferas se toquen como en este artículo donde los autores han encontrado nuevos empaquetamientos bi-dispersos. Gracias.

http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/jp206115p

Answer 1

He encontrado una respuesta parcial para encontrar una gran base de datos de empaquetamientos de esferas, ¡gracias al comentario de permeakra!

Hasta ahora he estado obteniendo archivos .cif de las grandes bases de datos de estructuras cristalinas en línea, como, http://www.crystallography.net/ . Una vez que tengo los archivos .cif uso openbabel para convertir esos archivos en archivos .xyz. A partir de aquí tengo una tabla que describe la estructura de un cristal mediante las coordenadas x, y, z de cada elemento en particular, por ejemplo,

\begin {array}{c|c c c} \ce {Mg} & 1.01054 & 1.01054 & 1.01054 \\\hline \ce {Al} & 1.01054 & 1.01054 & 1.01054 \\\hline \ce {Al} & 4.04217 & 4.04217 & 4.04217 \\\hline \ce {Mg} & 4.04217 & 4.04217 & 4.04217 \\\hline \ce {O} & 2.11390 & 2.11390 & 2.11390 \end {array}

Pero mi problema a partir de aquí es que babel no me ha devuelto el radio iónico que supongo que se puede recuperar online a través de la wikipedia o algo así. He publicado otra pregunta que es más específica a los archivos .cif que se expande en este problema que se puede encontrar aquí, Extracción de "radios de cristal" de un archivo CIF .\

Las limitaciones de este enfoque incluyen que sólo puedo encontrar empaquetamientos de esferas en 3D y es un procedimiento bastante largo y torpe para obtener muchos empaquetamientos de esferas.