Hay una diferencia, y recomiendo la tipología presentada por Lindsay (2015).
Lindsay (2015) presenta una tipología que define un hoyo como una sola celda en una DEM cuya elevación es inferior a la de las células que rodean y una depresión como una región de células que drenan hacia el interior de un pozo. Esto es consistente con las definiciones utilizadas por O'Callaghan y Mark (1984) en uno de los primeros documentos de la aplicación de enfoques algorítmicos para modelos digitales de elevación: "un pozo se define como un punto de ninguno de cuyos vecinos tienen elevaciones más bajas" y "la 'desbordamiento' punto se define como el punto que estaba en el límite de la cuenca y que tenía la mínima diferencia de elevación a la fosa."
Para establecer la frecuencia relativa de los términos, he realizado una búsqueda rápida de literatura.
El término "depresión" se utiliza en el anterior sentido por Jenson y Domingue (1988), Martz y Garbrecht (1999), Planchon y Darboux (2001), Jones (2002), Otto y Thurnherr (2007), Yong-Él et al. (2009).
Las palabras "hoyo" y "depresión" parecen ser utilizados indistintamente por Jenson y Trautwein (1987), Ehlschlaeger (1989), y Grimaldi (2007).
La palabra "mínimos" también se ha utilizado para designar tanto las depresiones y fosas por Vicente y Soille (1991) y Soille y Gratinado (1994). La palabra `sumideros" ha sido utilizado para designar tanto las depresiones y fosas por Olivera et al (2000) así como la de ESRI corporación en diversas guías de ArcGIS.
Una minoría de autores utilizaron la palabra pit: Tarboton et al (1991) y Soille (2004).