Trazado bares de intervalo de confianza de las estadísticas de Resumen

Question

Un poco como un diagrama de caja. No me refiero necesariamente a la norma superior del intervalo de confianza inferior del intervalo de confianza, promedio y rango de datos-mostrando los diagramas de caja, pero quiero decir, como un diagrama de caja con las tres piezas de datos: el 95% de intervalo de confianza y la media.

Esta es una captura de pantalla de un artículo de revista, que tenía exactamente lo que quiero:

También me gustaría saber cómo me gustaría utilizar el software de la contestadora de menciones para crear una trama.

Answer 1

Mira si esto te ayuda. Solución de R:

par(mfrow=c(2,1)) # to stack the charts on column

#Dataset 1

upperlimit = c(10,12,8,14)
lowerlimit = c(5,9,4,7)
mean = c(8,10,6,12)

df = data.frame(cbind(upperlimit,lowerlimit,mean))

plot(df$mean, ylim = c(0,30), xlim = c(1,4))

install.packages("plotrix")
require(plotrix)
plotCI(df$mean,y=NULL, uiw=df$upperlimit-df$mean, liw=df$mean-df$lowerlimit, err="y",      pch=20, slty=3, scol = "black", add=TRUE)

#Dataset 2

upperlimit_2 = upperlimit*1.5
lowerlimit_2 = lowerlimit*0.8
mean_2 = upperlimit_2-lowerlimit_2

df_2 = data.frame(cbind(upperlimit_2,lowerlimit_2,mean_2))

plot(df$mean_2, ylim = c(0,30), xlim = c(1,4))

plotCI(df_2$mean_2,y=NULL, uiw=df_2$upperlimit_2-df_2$mean_2, liw=df_2$mean_2-   df_2$lowerlimit_2, err="y", pch=20, slty=3, scol = "black", add=TRUE)

rm(upperlimit,lowerlimit,mean,df,upperlimit_2,lowerlimit_2,mean_2,df_2) #remove the objects stored from workspace

par(mfrow=c(1,1)) # go back to default (one graph at a time)

Answer 2

En MATLAB, es posible que desee probar el errorbar función: http://www.mathworks.de/de/help/matlab/ref/errorbar.html

Alternativamente, usted puede hacer el tonto y de forma manual. Por ejemplo, dada una matriz de datos de los puntos "a", se puede calcular su significa usar la función m = mean(a), calcular el CIs (dependiendo de lo que CI necesita), y registrar los resultados a mano.

Demostración si usted ya conoce la media y la CI, asumiendo la Cei están en una matriz de CI (primera y segunda columna) y los medios están en una matriz de un:

plot(1:length(CI),a,'o','markersize', 10)           % plot the mean
hold on;
plot(1:length(CI),CI(1,:),'v','markersize', 6)              % plot lower CI boundary
hold on;
plot(1:length(CI),CI(2,:),'^','markersize', 6)              % plot upper CI boundary
hold on;

for I = 1:length(CI)                                        % connect upper and lower bound with a line
line([I I],[CI(1,I) CI(2,I)])
hold on;
end;

axis([0 length(CI)+1 min(CI(1,:))*0.75 max(CI(2,:))*1.25])  % scale axis

Demostración en el caso donde se sabe que las mediciones individuales, para medidas repetidas experimento, 3+ condiciones, una condición por la columna, un tema cada línea de la matriz a, no faltan muestras, 95% CI como por MATLAB del prueba.t():

[H,P,CI] = ttest(a);                                        % calculate 95% CIs for every column in matrix a
                                                            % CIs are now in the matrix CI!

plot(1:length(CI),[mean(a)],'o','markersize', 10)           % plot the mean
hold on;
plot(1:length(CI),CI(1,:),'v','markersize', 6)              % plot lower CI boundary
hold on;
plot(1:length(CI),CI(2,:),'^','markersize', 6)              % plot upper CI boundary
hold on;

for I = 1:length(CI)                                        % connect upper and lower bound with a line
line([I I],[CI(1,I) CI(2,I)])
hold on;
end;

axis([0 length(CI)+1 min(CI(1,:))*0.75 max(CI(2,:))*1.25])  % scale axis

Answer 3

Este tipo de trama en R usando ggplot2, aunque usted tenga que hacer algunos retoques con el tamaño de fuente del eje:

library(ggplot2)
data.estimates = data.frame(
  var   = c('1', '2', '3', '4', '5', '6', '7', '8', '9'),
  par = c(1.12210,0.18489,1.22011,1.027446235,0.43521,0.53464,1.93316,-0.43806,-0.12029),
  se = c(0.42569,0.32162,0.58351,0.771608551,0.24803,0.65372,0.92717,0.45939,0.51558))
data.estimates$idr <- exp(data.estimates$par)
data.estimates$upper <- exp(data.estimates$par + (1.96*data.estimates$se))
    data.estimates$lower <- exp(data.estimates$par - (1.96*data.estimates$se))

p2 <- ggplot(hospital.estimates, aes(var,idr, size=10)) + theme_bw(base_size=10))
p2 + geom_point() +geom_errorbar(aes(x = var, ymin = lower, ymax = upper, size=2), width = 0.2) + scale_y_log10(limits=c(0.1, 50), breaks=c(0.1, 0.5, 1, 5, 10, 25, 50)) + xlab("Site") + ylab("RR")

Answer 4

En uso de Stata serrbar o ciplot (SSC) o eclplot (Stata Journal, SSC).

Answer 5

GraphPad Prism puede hacer fácilmente este tipo de gráfico, trazado barras de error de los valores de error que entrar. Crear una tabla agrupada con formato de entery de media, - error y + error.