¿Qué significa un valor de p de media exactamente 1.0000?

Question

Tengo una tabla de comparación pares mediante pruebas de t pareadas, que produje usando el siguiente código en R:

with(d_OAI, pairwise.t.test(OAI, Ven,p.adjust.method="bonferroni", paired=T))

Algunos de los valores de p son significativa (es decir, menos de 0.05) y algunos no son. Sin embargo, varios de los valores de p igualan a 1.00000. ¿Supongo que esto significa las dos cosas definitivamente no son significativamente diferentes, pero es este R redondeo de 0.9999 o es significativo un valor p de 1.000?

Answer 1

No conozco las funciones específicas de la R, pero si hay una corrección de Bonferroni, creo que es probable que sea la explicación. Por ejemplo, supongamos que usted probó dos hipótesis y conseguía p = 0.6, 0.6. El ajuste de Bonferroni simplista sería 1.2, 1.2, pero puesto que no son probabilidades válidas, truncaría a 1.0 y 1.0.

Answer 2

Si los datos son discretos es posible obtener un valor p exacto de 1 en una prueba de t pareada, cuando la diferencia de medias es exactamente 0.

De lo contrario, sí, un valor apenas menor que 1 puede ser mostrado como 1 en un número determinado de cifras significativas.

Answer 3

@Acantilado-ab proporcionado ya una respuesta correcta. En caso de que desee obtener más conocimiento sobre el significado de los obtenidos de los valores de p, haciendo un histograma a partir de ellas (antes de la corrección de las pruebas múltiples) puede ser de ayuda.

En particular, como muy bien descrito por @david-robinson en http://varianceexplained.org/statistics/interpreting-pvalue-histogram/, p-valores cercanos a 1.0 puede indicar que ha sido la aplicación de un solo lado de la prueba, cuando quizás usted quería una prueba de dos caras o puede ser causada por falta de valores en los datos, distorsionando los resultados de la prueba. Otra opción (como @Acantilado-AB menciona) es la corrección de Bonferroni que usted está solicitando, que parece ser la más plausible causa.