I) En general, es cierto que si conectamos un local de Lagrange
$$\tag{1} L\quad \longrightarrow \quad \tilde{L}~=~L+\frac{df}{dt}$$
modificado con un total de término derivado en la de Euler-Lagrange expresión
$$\tag{2} \sum_{n} \left(-\frac{d}{dt}\right)^n \frac{\partial \tilde{L}}{\partial q^{(n)}}~=~\sum_{n} \left(-\frac{d}{dt}\right)^n \frac{\partial L}{\partial q^{(n)}}, $$
se produciría de forma idéntica el mismo Euler-Lagrange de expresión sin ningún tipo de restricciones en $L$$f$.
II) La advertencia es que el de Euler-Lagrange de la expresión (2) es sólo$^1$ físicamente legítimo, si se tiene una interpretación física como un variacional/funcional derivado de un principio de acción. Sin embargo, la existencia de un variacional/funcional derivado es un problema no trivial, que se basa en el bien planteado las condiciones de contorno para el problema variacional. Ver también esta relacionada con Phys.SE post. En la llanura inglés: las condiciones de frontera son necesarios en orden a justificar la integración por partes.
III) UN Lagrangiano $L(q,\dot{q},\ldots, q^{(N)},t)$ orden $N$ conduce a la ecuación de movimiento de la orden de $\leq 2N$. Normalmente se requiere el Lagrangiano $L(q,\dot{q},t)$ a ser de primer orden $N=1$. Ver, por ejemplo, este y este Phys.SE postes.
IV) Concretamente, supongamos que se nos da un primer orden de Lagrange $L(q,\dot{q},t)$. Si uno redefine el Lagrangiano con un total de derivados
$$\tag{3} \tilde{L}(q, \dot{q}, \ddot{q}, t)~=~L(q, \dot{q}, t)+\frac{d}{dt}f(q, \dot{q}, t), $$
donde $f(q, \dot{q}, t)$ depende de la velocidad de $\dot{q}$, entonces el nuevo Lagrangiano $\tilde{L}(q, \dot{q}, \ddot{q}, t)$ también puede depender de la aceleración de $\ddot{q}$, es decir, ser de orden superior.
V) Con un orden superior,$\tilde{L}(q, \dot{q}, \ddot{q}, t)$, podría tener que imponer las condiciones de contorno, a fin de obtener de Euler-Lagrange las ecuaciones desde el principio de acción estacionaria por el uso repetido de integraciones por partes.
VI) parece que el Prof. V. Balakrishnan en el vídeo tiene problemas de IV y V en mente cuando habló de "poner condiciones' en el sistema. Finalmente, OP también puede encontrar esta Phys.SE interesante post.
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$^1$ Aquí ignoramos derivaciones de las ecuaciones de Lagrange directamente de las leyes de Newton, es decir, sin el uso del principio de acción estacionaria, ya que por lo general no implican redefiniciones (3).