La explicación ya está en lo que has citado - Randall Munroe está diciendo simplemente y de forma bastante literal que una expresión como $(\ln x)^e$ es muy poco probable que aparezca en cualquier situación cuando se trabaja con las matemáticas, ya sean puras o aplicadas.
No es realmente un broma como tal; sólo está señalando algo que es absurdamente improbable. (Creo que es injusto para él llamarlo broma y juzgarlo como tal).
Aparte de todo esto, también está la cuestión de la notación y la familiaridad. Hay ciertas expresiones que se repiten en matemáticas, y fuera de los ejercicios de los libros de texto de cálculo sería bastante chocante encontrarse con que hay que encontrar la derivada de $c^x$ con respecto a $c$ y es casi psicológicamente más difícil de hacer que encontrar la derivada de $x^c$ con respecto a $x$ aunque sean totalmente equivalentes desde el punto de vista matemático.
Sobre la notación, Halmos ha aludido a esto en su Cómo escribir matemáticas :
A medida que la historia avanza, más y más símbolos se congelan. Los ejemplos estándar son $e$ , $i$ y $\pi$ y, por supuesto, $0$ , $1$ , $2$ , $3$ , . (¿Quién se atrevería a escribir "Que $6$ ser un grupo"). Otras cartas están casi congeladas: muchos lectores se sentirían ofendidos si " $n$ " para un número complejo, " $\varepsilon$ " para un número entero positivo, y " $z$ "para un espacio topológico. (La pesadilla de un matemático es una secuencia $n_\varepsilon$ que tiende a cero como $\varepsilon$ se convierte en infinito).
Relacionado, de Consejos de Milne para los autores (citando la Miscelánea de Littlewood, p60):
Se dice de los escritos de Jordán que si tuviera 4 cosas al mismo nivel (como $a,b,c,d$ ) aparecerían como $a$ , $M_3'$ , $\varepsilon_₂$ , $\Pi''_{₁,₂}$ ."
