¿Es más conservador como el número de comparaciones aumenta Benjamini-Hochberg corrección?

Question

¿Cómo conservador es Benjamini-Hochberg corrección pruebas múltiples en relación con el número total de comparaciones? Por ejemplo, si tengo una lista de características de 18.000 para dos grupos y realizar una prueba de Wilcoxon para obtener un valor de p. Ajustar ese valor de p usando Benjamini-Hochberg y nada sale como significativo.

¿Sé que la corrección de Bonferroni puede ser bastante conservador como el número de comparaciones aumenta, Hochberg Benjamini tiene la misma propiedad?

Answer 1

En primer lugar, es necesario comprender que estos dos procedimientos de pruebas múltiples no el control de la misma cosa. Usando tu ejemplo, tenemos dos grupos con 18,000 las variables observadas, y de hacer de 18.000 pruebas con el fin de identificar algunas variables que son diferentes de un grupo a otro.

• La corrección de Bonferroni controla la tasa de error Familywise, que es la probabilidad de que, suponiendo que todos los 18.000 variables tienen idéntica distribución en los dos grupos, que son falsamente "aquí tengo algunas diferencias significativas". Generalmente, usted decide que si esta probabilidad es < 5%, su reclamo es creíble.

• Benjamini-Hochberg controles de corrección de la tasa de Falso descubrimiento, es decir, la proporción esperada de falsos positivos entre las variables para las que se afirman la existencia de una diferencia. Por ejemplo, si con FDR controlado a 5% 20 pruebas son positivas, "en promedio" sólo 1 de estos exámenes será un falso positivo.

Ahora, cuando el número de comparación aumenta... bueno, depende del número de marginal hipótesis nula de que son verdaderas. Pero básicamente, con ambos procedimientos, si usted tiene un par, vamos dice 5 o 10, realmente las variables asociadas, tiene más posibilidades de detectar entre 100 variables, de entre 1.000.000 de variables. Que debe ser lo suficientemente intuitiva. No hay forma de evitar esto.