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La confusión sobre lmer y los valores de p

Yo estaba bajo la impresión de que la función lmer() en la lme4 paquete no producir los valores de p (ver lmer, los valores de p y todo eso).

He estado usando MCMC generaron valores de p, en cambio, como por esta pregunta: efecto Significativo en lme4 modelo mixto y esta pregunta: no se Puede encontrar los valores de p en la salida de lmer() en la lm4 paquete en R.

Recientemente he intentado un paquete llamado memisc y su getSummary.mer() para obtener los efectos fijos de mi modelo en un archivo csv. Como si por arte de magia, una columna llamada p parece que coincide con mi MCMC los valores de p muy de cerca (y no sufrir el tiempo de procesamiento que viene con el uso de pvals.fnc()).

He provisionalmente había un vistazo a el código en getSummary.mer , y han descubierto la línea que genera el valor de p:

p <- (1 - pnorm(abs(smry@coefs[, 3]))) * 2

¿Esto significa que los valores de p se pueden generar directamente desde lmer's de salida en lugar de correr a pvals.fnc? Me doy cuenta de esto no hay duda de iniciar el 'valor de p fetichismo del debate, pero me interesa saber. Yo no he oído memisc mencionó antes, cuando se trata de lmer.

Para ser más conciso: ¿Cuál es el beneficio (si existe) de la utilización de MCMC p-valores superiores a los generados por getSummary.mer()?

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Nathan Black Puntos 61

Yo soy el autor original de la getSummary.mer función. El reporte de la p-valores sólo deben ser utilizados como una comprobación rápida. Si mal no recuerdo, en realidad, sólo se incluye el p-valores para hacer que funcione en el marco establecido por memisc. Pero esto realmente debe ser proporcionado con una advertencia apropiada para el usuario, y me pondré en contacto con el mantenedor del paquete para que este agregado. Mi consejo es que siga la proporcionada por Doug Bates: MCMC es la apuesta más segura (suponiendo que los demás no tienen mejores opciones).

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