La razón por la que podemos utilizar la transformada de Fourier para resolver ecuaciones diferenciales es debido a que el siguiente diagrama conmuta (del mismo artículo de la Wikipedia):
El diagrama conmutativo es simplemente un razonamiento dispositivo que ayuda a clarificar la relación entre determinados procesos/funciones. A menudo, el hecho de que un diagrama de desplazamientos significa que podemos expresar el mismo resultado en dos (o más) formas.
Cada una de estas formas puede tener sus ventajas o desventajas, pero sabiendo que ellos dan el mismo resultado (es decir, el diagrama de desplazamientos) nos da la libertad para elegir el método que mejor se adapte a nuestros propósitos.
En los casos más sencillos (como la transformada de Fourier), un diagrama conmutativo, probablemente, sólo nos dice algo que ya sabemos. Sin embargo, en sistemas más complejos/situaciones, el dibujo de un diagrama conmutativo podría ayudarle a ver/hacer uso de/dar sentido a las relaciones que de otra forma hubieran perdido.