Existen muchas formas de realizar cálculos de potencia para determinar el tamaño de muestra ideal. Una de esas formas, como mencionas, es elegir un valor umbral de "A alguien le importará". Esto puede estar determinado por el conocimiento previo, la creencia de que en tu campo no se interesan particularmente hasta que un efecto sea de un tamaño específico, etc.
Mi sugerencia es en cambio observar una gama de posibles tamaños de efecto. Es trivialmente fácil, si estás realizando un cálculo de potencia, realizar varios para evaluar la sensibilidad de tu umbral. Por ejemplo, ¿estarás realmente bien con que tu estudio tenga falta de potencia si fijas tu umbral en 5% y resulta ser 4.9%? ¿O 3%? ¿O un efecto real en absoluto?
La figura a continuación, por ejemplo, pregunta (para un tamaño de muestra fijo en este caso), cuál es la potencia del estudio bajo una gama de posibles ratios Expuesto:No expuesto y tamaños de efecto. Sería igual de fácil componer un gráfico similar variando la población de estudio para comprender más ampliamente la potencia de tu estudio.
También parece que estás preguntando si puedes utilizar un tamaño de muestra pequeño para "suprimir" resultados particulares. Puedes diseñar un estudio y reconocer que las limitaciones de tamaño de muestra resultarán en falta de potencia para ciertos tamaños de efecto, pero no lo haría deliberadamente. Encontrar un efecto nulo o pequeño sigue siendo un hallazgo, y subestimar deliberadamente un estudio parece...erróneo. Además, el tamaño de muestra óptimo obtenido del análisis de potencia a menudo es algo optimista, casi nunca incluye datos faltantes, un análisis de subgrupo interesante u otros problemas que requerirán una muestra más grande. Establecer una línea dura es una mala idea.