Desde una perspectiva frecuentista, una comparación no ajustada basada en la distribución de permutación siempre puede justificarse siguiendo un estudio (adecuadamente) aleatorizado. Una justificación similar puede hacerse para la inferencia basada en distribuciones paramétricas comunes (por ejemplo, la distribución t o la distribución $F) debido a su similitud con la distribución de permutación. De hecho, ajustar por covariables, cuando se seleccionan basadas en análisis post hoc, realmente corre el riesgo de inflar el error de Tipo I. Tenga en cuenta que esta justificación no tiene nada que ver con el grado de equilibrio en la muestra observada, o con el tamaño de la muestra (excepto que para muestras pequeñas la distribución de permutación será más discreta, y menos bien aproximada por las distribuciones t o $F).
Dicho esto, muchas personas son conscientes de que ajustar por covariables puede aumentar la precisión en el modelo lineal. Específicamente, ajustar por covariables aumenta la precisión del efecto del tratamiento estimado cuando son predictivos del resultado y no están correlacionados con la variable de tratamiento (como es cierto en el caso de un estudio aleatorizado). Sin embargo, lo que es menos conocido es que esto no se transfiere automáticamente a modelos no lineales. Por ejemplo, Robinson and Jewell [1] muestran que en el caso de la regresión logística, controlar por covariables Reduce la precisión del efecto del tratamiento estimado, incluso cuando son predictivas del resultado. Sin embargo, debido a que el efecto del tratamiento estimado también es mayor en el modelo ajustado, controlar por covariables predictivas del resultado Lo hace aumentar la eficiencia al probar la hipótesis nula de que no hay efecto de tratamiento después de un estudio aleatorizado.
[1] L. D. Robinson y N. P. Jewell. Algunos resultados sorprendentes sobre el ajuste de covariables en modelos de regresión logística. International Statistical Review, 58(2):227-40, 1991.