Se podría hacer una analogía entre la distribución de la presión de una onda sonora y la distribución de la densidad de la masa de un muelle realista que experimenta vibraciones, pero no te daría la explicación que buscas. De hecho, eso sería más como explicar una onda sonora en términos de resortes, en lugar de lo que estás tratando de hacer, es decir, explicar un resorte en términos de ondas.
Aunque no estoy muy familiarizado con los detalles, básicamente lo que ocurre a nivel microscópico de un muelle es que, cuando el muelle está en equilibrio, los átomos están dispuestos en una especie de estructura rígida. Cualquier par de átomos tiene una energía potencial que es una función de la distancia entre esos dos átomos, así que todo el muelle tiene una energía potencial determinada por todas las distancias entre cada par de átomos posible:
$$U = \sum_{i,j} U_{ij}(r_{ij})$$
En equilibrio, el muelle adoptará una forma que minimice esta energía potencial total.
Si lo piensa, un muelle metálico suele formarse calentando un poco de metal para hacerlo maleable (o incluso fundiéndolo), y luego dándole la forma deseada antes de que se enfríe. El calor permite que los átomos se muevan con relativa libertad para que puedan alcanzar la configuración de equilibrio que minimiza su energía potencial, y una vez que el muelle se enfría, se congelan en su lugar.
Por supuesto, los átomos no son completamente congelado en el lugar. Como veo que Georg ya ha escrito en su respuesta, la energía potencial entre dos átomos ( $U_{ij}(r_{ij})$ ) tiene un mínimo en su distancia de equilibrio y va subiendo a cada lado. Si añades algo de energía al sistema, por ejemplo ejerciendo una fuerza sobre él, puedes conseguir que los átomos se acerquen o se alejen. Cuando se estira o se comprime una cuerda, en realidad se está haciendo esto a todos los (pares de) átomos del muelle simultáneamente. Por supuesto, los átomos "intentarán" volver a su posición de equilibrio, es decir, "intentarán" minimizar su energía potencial, y esto es lo que se siente como la fuerza de restauración de un muelle bajo tensión.