Bueno, para ser realmente pedante, casi todo son datos. Cualquier medición u observación es un dato. Supongo que definiría los datos como cualquier pieza de información, independientemente de cómo se haya obtenido o de si es válida.
Por supuesto, creo que tu pregunta se refería realmente a lo que se consideraría una prueba, en el contexto de proporcionar apoyo u oposición a un modelo teórico. Yo diría que la respuesta depende mucho de la situación. Utilizando los resultados de la simulación como ejemplo, ya que estaba en tu pregunta, yo tomaría con certeza los resultados de la simulación en apoyo de alguna teoría, pero sólo con la condición de que la simulación haya sido muy bien validada contra el experimento. Los detalles de cómo y por qué los resultados de la simulación son favorables a la teoría también son ciertamente importantes.
En última instancia, toda la ciencia debe ser validada por el experimento o la observación, pero eso puede ser a veces un largo camino, y definitivamente hay un lugar para otro tipo de datos en el camino.