Para tratar de dar un poco más de detalle que la otra respuesta - la energía de un solo protón en un "destrozador de átomos" como el LHC es menor que la energía cinética de un mosquito volador típico:
https://www.lhc-closer.es/taking_a_closer_look_at_lhc/0.energy
Por supuesto, el truco está en que la energía del mosquito se distribuye entre sus $\sim 10^{23}$ otras moléculas, en lugar de centrarse en un solo átomo, como en el LHC.
Además, las interacciones que se producen durante la colisión no son el mismo tipo de reacciones que se producen en algo como un arma nuclear. En esas armas, se requiere algún tipo de efecto cascada: aproximadamente, cada desintegración atómica produce más decae, por lo que el efecto es explosivo. Esto se ve facilitado por un material de densidad relativamente alta (por lo que hay más núcleos alrededor para desintegrarse). Esto es lo contrario que ocurre en el LHC, en el que la densidad es muy baja - como 1 o varias interacciones protón-protón a la vez.
De hecho, existen hipotéticos peligros derivados de estos experimentos de alta energía. Por ejemplo, ya que crean alta energía densidad situaciones, en principio podrían formarse cosas como Agujeros Negros. Sin embargo, como la energía sigue siendo relativamente pequeña, estos agujeros negros serían microscópicos y no supondrían ningún peligro para los experimentadores ni para el mundo:
https://angelsanddemons.web.cern.ch/faq/black-hole.html
En realidad, sería un increíble ¡logro científico si pudiéramos producir un agujero negro cuántico así!