Creo que la respuesta aquí es la misma que en cualquier lugar en ciencia de datos: depende de los datos :-)
Puede suceder que un método supere a otro (aquí https://arimo.com/data-science/2016/bayesian-optimization-hyperparameter-tuning/ la gente compara la optimización bayesiana de hiperparámetros y logra un mejor resultado en el desafío Kaggle de crimen en San Francisco que con la búsqueda aleatoria), sin embargo dudo que haya una regla general para eso. Puedes ver un buen gif aquí (http://blog.revolutionanalytics.com/2016/06/bayesian-optimization-of-machine-learning-models.html) donde la gente muestra el 'camino' que toma la optimización bayesiana en el paisaje de hiperparámetros, en particular, no parece que supere a la búsqueda aleatoria en general...
Creo que la razón por la que la gente tiende a usar la optimización bayesiana de hiperparámetros es que simplemente se necesitan menos pasos de entrenamiento para lograr un resultado comparable en comparación con la búsqueda aleatoria con un número suficientemente alto de experimentos.
Resumiendo en una frase:
*Cuando el tiempo de entrenamiento es crítico, usa la optimización bayesiana de hiperparámetros y si el tiempo no es un problema, elige uno de los dos...*
Por lo general, soy demasiado perezoso para implementar la parte bayesiana con Procesos Gaussianos si puedo lograr el mismo resultado con la búsqueda aleatoria... Simplemente entreno conjuntos de Gradient Boosting en 'pocos' datos, así que para mí, el tiempo no es un problema...
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Google ahora está vendiendo sus servicios en la nube de aprendizaje profundo y promocionando una función que ajusta automáticamente sus hiperparámetros con optimización bayesiana... por supuesto, afirmando que es el mejor y también más rápido (buscando en el espacio de hiperparámetros de manera más eficiente). Hay varios documentos por ahí que evalúan BO vs RS, mostrando que BO es apenas un poco mejor. En mi opinión, por lo que he visto, la diferencia es algo que te importaría más en una competencia de Kaggle que en la vida real.