Esto puede ayudar a aclarar el problema con los "axiomas" observando cómo el significado de esa palabra ha cambiado. En Euclid los Elementos, y por mucho tiempo después de eso, un "axioma" o "postulado" no era sólo de la sentencia: un axioma tuvo que ser obviamente cierto y evidente, por lo que no se necesitaban pruebas. En este sentido tradicional, la negación del postulado paralelo no califican como una "axioma", porque no es obviamente cierto. Por ejemplo, el alboroto sobre el postulado paralelo comenzó porque no estaba claro que el postulado paralelo era lo suficientemente evidente.
En la moderna lógica, nos preocupamos mucho menos acerca de la "auto-evidente" requisito [1]. Cuando estamos trabajando en completar la generalidad, $S$ de las sentencias puede ser considerado como un conjunto de axiomas. El conjunto de todas las sentencias que se puede deducir de $S$ a continuación, es el deductivo de cierre de $S$. Con este reductora significado de "axioma", ya no hay mucha diferencia entre una teoría y un conjunto de axiomas. Podríamos considerar que cada frase en la teoría para ser un axioma, por ejemplo, mientras que Euclides no aceptaría cada declaración comprobable forma sus postulados como un postulado.
La palabra "teoría", como matt dice en su respuesta, se utiliza de varias maneras. A veces se usa para indicar un resultado cerrado conjunto de oraciones, y a veces se utiliza para referirse a cualquier conjunto de oraciones, que también podría ser llamado un conjunto de axiomas. En la mayoría de los ajustes, se puede sustituir un conjunto de axiomas con su (único) deductivo de cierre cuando sea necesario, de modo que la diferencia entre las dos convenciones no es muy sustancial.
Hay uno más en el significado de "teoría" quiero señalar. He mencionado las teorías que se generan al tomar el deductivo de cierre de un conjunto de oraciones que son tratados como axiomas. Otra manera de formar una teoría es tomar alguna clase de estructuras semánticas, en la misma firma y, a continuación, forman el conjunto de todos los enunciados que son verdaderos en todas las estructuras de la clase. Por ejemplo, uno puede formar la "teoría de abelian grupos" y la "teoría de la recta real". Tales teorías siempre será deductiva cerrado. La diferencia aquí es que no comenzamos con un conjunto de axiomas.
[1] Nosotros no se preocupe acerca de la auto-evidencia cuando estamos tratando de justificar fundacional de la teoría ZFC. Y los axiomas asumimos que a menudo son obviamente cierto, en cuyo caso no hay ningún problema. Pero también tenemos en axiomas como el axioma de determinación, que es disprovable en ZFC. Algunos de los usos tradicionales sigue siendo, pero sólo en ciertos contextos.