Si esa es tu definición, entonces cada $x,y\in A$ están en homotopía, en cualquier C $^*$ -Álgebra: sólo tienes que tomar $$ \gamma(t)=(1-t)x+ty,\ \ \ t\in[0,1]. $$
La respuesta a su última pregunta es no. $A=\mathbb C\oplus\mathbb C\subset M_2(\mathbb C)$ representado como $$ A=\left\{\begin{bmatrix}a&0\\0&b\end{bmatrix}:\ a,b\in\mathbb C\right\}\subset M_2(\mathbb C), $$ and consider homotopy in the corresponding sets of projections. Let $$ p=\begin{bmatrix}1&0\\0&0\end{bmatrix},\ \ q=\begin{bmatrix}0&0\\0&1\end{bmatrix}. $$ Then $p$ and $q$ are homotopic via projections in $M_2(\mathbb C)$, by $$ \gamma(t)=\begin{bmatrix}t&\sqrt{t-t^2}\\ \sqrt{t-t^2}&1-t\end{bmatrix},\ \ t\in[0,1], $$ pero no son homotópicas por proyecciones en $A$ .
Con las mismas álgebras, y unitarios: $$ u=\begin{bmatrix}1&0\\0&-1\end{bmatrix},\ \ v=\begin{bmatrix}-1&0\\0&1\end{bmatrix}. $$ son homotópicas mediante unitarios en $M_2(\mathbb C)$ por $$ \gamma(t)=\begin{bmatrix}\cos t\pi&\sin t\pi \\ \sin t\pi&-\cos t\pi\end{bmatrix},\ \ t\in[0,1], $$ pero no son homotópicos por unitarios en $A$ .