No sé cómo es este escudo, pero voy a suponer que la batería es extraíble / reemplazable. ¿Es ese el caso?
¿Venía con batería o era usted quien tenía que ponérsela?
El DS1307 tiene una pequeña peculiaridad y es que requiere que Vbat esté conectado a tierra cuando no hay una batería de reserva conectada. R5 está destinado a bajar Vbat a tierra en ausencia de una batería de respaldo. Sin esa resistencia, el DS1307 no funcionaría correctamente si uno intentara usarlo sin una batería instalada y alimentado a través de la placa base/VCC del ESP.
De la hoja de datos del DS1307:
Si no se requiere una alimentación de reserva, VBAT debe conectarse a tierra.
Ahora bien, ¿es una buena solución a este requisito? ...La verdad es que no. Para una célula de 48mAh 3V, esto reducirá el mejor tiempo de reserva posible a 3 años, y el drenaje ocurrirá incluso cuando el DS1307 esté funcionando con VCC.
Sin embargo, puedo entender su razonamiento. Es un escudo, está dirigido a un público bastante amplio y probablemente tomaron la decisión de que sería mejor que el DS1307 funcionara en todos los casos de uso posibles en lugar de mantener la hora durante una década.
Dicho esto, siempre que no tengas pensado utilizarlo sin una batería de reserva instalada, puedes simplemente quitarla y eliminar esa fuente de descarga de la batería.