Dado el siguiente diseño experimental:
Múltiples muestras son tomadas de un sujeto y de cada muestra es tratada de varias maneras (como un tratamiento de control). ¿Cuál es principalmente interesante es la diferencia entre el grupo control y de cada tratamiento.
Puedo pensar en dos modelos simples para este tipo de datos. Con la muestra $i$ tratamiento $j$, el tratamiento, siendo 0 el control, vamos a $Y_{ij}$ ser los datos, $\gamma_i$ ser la base para la muestra $i$, $\delta_j$ ser la diferencia para el tratamiento de la $j$. El primer modelo se ve tanto en el control y la diferencia:
$$ Y_{ij}=\gamma_i+\delta_j+\epsilon_{ij} $$ $$ \delta_0=0 $$
Mientras que el segundo modelo sólo se ve la diferencia. Si queremos calcular previamente $d_{ij}$ antemano $$ d_{ij}=Y_{ij}-Y_{i0} $$ entonces $$ d_{ij}=\delta_j+\varepsilon_{ij} $$
Mi pregunta es ¿cuáles son las diferencias fundamentales entre estas dos configuraciones? En particular, si los niveles no tienen sentido en sí mismos y sólo la diferencia que importa, es el primer modelo haciendo demasiado y tal vez de poca potencia?