OK mi idea es que el número total de posibles cadenas ternarias de longitud $n$ es $3^n$ de las que debo restar las cadenas que contienen $000$ s más las cadenas que contienen $11$ s, excluyendo el número de duplicados (cadenas que contienen ambos $000$ s y $11$ s).
Secuencia para cadenas que contienen 000s: $$f(n)=3\times f(n-1)+2\times(3^{n-4}-f(n-4))$$ Secuencia para cadenas que contienen 11s: $$f(n)=3\times f(n-1)+2\times(3^{n-3}-f(n-3))$$
Ahora, las cadenas que contienen ambas secuencias: Para $n=5$ obtenemos $2$ ( $00011$ y $11000$ ).
Para $n=6$ obtenemos $12$ y para $n=7$ obtenemos $73$ (simplemente produciendo las permutaciones).
Para $n>5$ entiendo que debemos considerar dos casos diferentes, el primero (o último) $5$ dígitos que forman una secuencia "buena" (es decir, que contiene ambas secuencias), en cuyo caso, los restantes $n-5$ puede ser cualquier cosa (lo que nos da $3^{n-5}$ más combinaciones, o $f(n-1)$ ser "malo".
En este caso, ¿cómo podemos distinguir si sólo contiene $000$ s o $11$ s o ninguno de los dos?
En resumen, ¿cómo encontramos la relación de recurrencia para que las cadenas contengan ambos ?