Tienes razón, es la matriz de transición de dos estados en toda su generalidad. Para encontrar un vector de equilibrio, resolvemos: \begin{align} \begin{bmatrix} x & y \end{bmatrix} \cdot \begin{bmatrix} p & 1-p \\ q & 1-q \end{bmatrix} = \begin{bmatrix} x & y \end{bmatrix} , \fin que da lugar al sistema \begin{equation} \left\{ \begin{aligned} px+qy&=x \\(1-p)x+(1-q)y&=y \end{aligned} \Muy bien. . \Fin. La segunda ecuación es redundante, \begin{align} y &=(1-p)x+(1-q)y \\&=x+y-(px+qy) \\&=x+y-(x) \\&=y, \end{align} así que sólo tenemos que resolver la primera. Ahora, elige cualquier valor no negativo de $x$ entonces \begin{equation} y=\frac{(1-p)x}{q} \end{equation} es un número no negativo, y el par $(x,y)$ resolver la primera ecuación (comprobar). Por último, si $(x,y)$ resolver la primera ecuación, entonces $(sx,sy)$ para cualquier $s$ también resuelve la primera ecuación, porque \begin{align} sx &=psx+qsy \\&=s(px+qy) \\&=s(x) \end{align} desde $px+qy=x$ . Dejando que $s=\frac{1}{x+y}$ garantizamos $sx+sy=1$ lo que significa \begin{bmatrix} sx & sy \end{bmatrix} es el vector de equilibrio que deseamos.
Espero que le sirva de ayuda.