¿Para qué sirve ese inductor?
Como señalas, el inductor conecta la red de alimentación de la placa base a una entrada de alimentación de corriente continua del uC.
El propósito del inductor es asegurarse de que la entrada al pin AVCC es realmente dc; incluso si hay algo de ruido en la red principal de +5V.
Por ejemplo, a medida que la lógica digital del uC cambia de estado, se producen impulsos de corriente en el pin VCC. Esto hará que la red de +5V tenga pequeñas variaciones de tensión. El inductor aísla el pin AVCC para que estas ondulaciones no lo afecten.
Si sustituyes el inductor por un cortocircuito, es posible que veas algo más de ruido en las lecturas del ADC realizadas en las entradas analógicas del uC.
Editar
En primer lugar, me di cuenta de que esta es una placa de una sola cara, y mirando los archivos en el sitio web de SSA parece que esto ha causado algunos compromisos en el diseño --- en particular la falta de una tierra sólida y planos de potencia. Con esto en mente, si quieres usar las entradas analógicas, probablemente sea una buena idea tener algún tipo de inductor aquí. Si fuera por mí, también añadiría algunos condensadores de mayor valor (digamos 1 uF y 10 uF) en paralelo con C3 y C6... pero eso podría no ser realista por razones mecánicas.
27 uH, +/-10%. ¿Es un reemplazo lo suficientemente bueno para L1?
La placa debería ser totalmente funcional si se utiliza esta pieza. Sin duda valdría la pena construirla así y probarla.
Si ves un ruido excesivo (más de lo que tu aplicación puede permitir) en las entradas analógicas, entonces deberías trabajar más para encontrar un inductor de 100 uH. O bien, para una rápida chapuza, conecta dos (o más) de tus piezas de 27 uH en serie.