PostGIS es opensource, de hecho puedes crear una nueva función para ST_INTERSECT con Tolerancia como entrada o actualice la propia función con el valor que le interese y, a continuación, ejecútela.
Aquí está el fragmento de código donde la tolerancia es dinámica, puede ejecutar la secuencia de comandos a continuación en su base de datos y se creará en el esquema público:
CREATE OR REPLACE FUNCTION ST_Intersects(geography, geography,float8)
RETURNS boolean
AS 'SELECT $1 && $2 AND _ST_Distance($1, $2, 0.0, false) < $3'
LANGUAGE 'sql' IMMUTABLE ;
Enlace para la función original de ST_Intersects(geo,geo):
https://github.com/postgis/postgis/blob/c0998a4e638048196a6abfab1504eca6b1a1462f/postgis/geography.sql.in#L720