Para cualquier instrumento que cuantifique mediante la integración de un pico (GC, RMN, etc.), la concentración de la muestra (altura del pico) es importante, especialmente con relaciones señal/ruido bajas. Obviamente, si el pico no se encuentra en el punto óptimo -por así decirlo- (donde su área es significativamente superior a la línea de base, pero no demasiado grande como para saturar el detector) la cuantificación puede ser poco fiable. La forma del pico también es un factor a tener en cuenta en la integración. Si el pico es demasiado ancho, gran parte del área bajo él puede quedar oculta por la línea de base. En GC/MS o GC/FID, en particular, solía tener problemas con los picos "de cola", es decir, una amplia asimetría persistente después del pico máximo que a menudo se solapaba con especies con tiempos de retención mayores. No es bueno para la cuantificación. Normalmente se solucionaba horneando la columna o buscando un mejor perfil/método de calentamiento.
Los métodos óptimos varían mucho en función del instrumento que se utilice, el disolvente, los componentes de la mezcla, las cantidades relativas y la concentración, etc. Mucho ensayo y error. Como regla general, sin embargo, cuando tengo 2 componentes que están cerca en rt, pero no se resuelven, me muevo a un método con una rampa mucho más lenta para la temperatura de la columna, aumentando el gas portador si es posible en su equipo podría ayudar, también.
