¿Qué preguntas haría un estadístico sobre el análisis de un brote de E. coli?

Question

Es posible que haya oído hablar del reciente brote de enterohemorrágica E. coli ( EHEC ) brote en Alemania .
¿Qué preguntas se haría un estadístico sobre el análisis de la EHEC?
Estoy pensando en Q+As entre periodistas / funcionarios públicos ↔ no expertos, por ejemplo, profesores e ingenieros con un diploma o un máster, pero como mucho con conocimientos de estadística.

(Es una imagen, un mapa del territorio EHEC que muestra varias cepas de EHEC y la cobertura de las distintas pruebas).

Lunes 20 de junio: Pensé que el brote de EHEC sería un área donde las estadísticas realmente importan en el mundo en general: ¿cuáles son las pruebas de las diversas causas, cómo se pueden comunicar al público? Así pues, comienzo una recompensa.

Answer 1

Si no tiene preguntas científicas a priori a las que quiera/necesite respuesta, yo me fijaría en la distribución espacial de los casos. En concreto, estimaría una especie de función de "intensidad" espacial, es decir, alguna función $f( {\bf s} ) = E({\rm prevalence} | {\rm \ you \ are \ in \ location \ } {\bf s} )$ . Para no sobreajustar los datos, sería conveniente suavizarlos, lo que permitiría "agrupar" las ubicaciones cercanas. El método más sencillo sería utilizar una función de estimación de la densidad del núcleo (por ejemplo, la función kde2d de R, aunque puede ser necesario preprocesar los datos). Esto ayudaría a identificar "puntos calientes" en la distribución espacial y podría llevar a un investigador a identificar reservorios ambientales de E. Coli.

Dependiendo de los demás datos de que se disponga, podrían utilizarse modelos espaciales más sofisticados que se ajusten a factores de confusión conocidos.