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Programa informático de regresión de la supervivencia con censura por intervalos y fragilidad

Estoy realizando un análisis de regresión sobre los datos del tiempo de sueño. Se trata de datos de encuestas y las posibilidades de respuesta son del tipo "menos de 4 h", "5 h", "6 h", etc., por lo que se puede pensar que son respuestas censuradas por intervalos de las horas de sueño reales de los individuos (por ejemplo, si una persona duerme 6,8 horas por noche, podría responder "7 h". Entonces, si alguien contestó "7 h", sabemos que la duración real del sueño está entre 6,5 y 7,5 horas). Los datos contienen mediciones repetidas. Cada individuo ha respondido a la misma pregunta en 4 estudios diferentes, que tienen un par de años de diferencia entre sí. Esto introduce un factor de agrupación, la fragilidad, en términos de regresión de supervivencia.

He buscado sin resultado un paquete de R, un módulo de Python o algo que pueda modelar la regresión de supervivencia con distribución Weibull, censura por intervalos y fragilidad. ¿Alguien conoce alguno?

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Cliff AB Puntos 3213

Si los intervalos con los que divide las cosas no se solapan (por ejemplo, todas las variables de respuesta terminan en intervalos disjuntos, como [0,2,5), [3,5,4,5), [4,5,5,5), etc.), le sugeriría que ignorar el aspecto de intervalo censurado de sus datos, y simplemente tratarlos como ordinales/discretos. Y yo soy partidario de utilizar métodos censurados por intervalos.

La razón es que cuando se utilizan estimadores de datos censurados por intervalos no paramétricos y semiparamétricos, si los intervalos no se solapan, los resultados son exactamente equivalentes a los resultados si se hubieran tratado como resultados discretos ordenados (es decir, 1 = [0,2,5), 2 = [2,5,3,5), etc.). Por lo tanto, no es necesario un programa informático especial; puede utilizar fácilmente R 's ordinal o incluso coxme para modelos de efectos mixtos.

Si por alguna razón que actualmente no tiene sentido para mí, sus intervalos de respuesta se superponen (es decir, por alguna razón usted cree que el tiempo exacto del sujeto 1 estaba en el intervalo [6-8), pero también cree que el tiempo exacto del sujeto 2 era [7-9)) O si está realmente comprometido con el uso de modelos totalmente paramétricos, puede ajustar modelos de regresión censurados por intervalo (los modelos AFT totalmente paramétricos se pueden encontrar en la sección survival se pueden encontrar modelos no paramétricos, semiparamétricos y totalmente paramétricos de probabilidades proporcionales y riesgos proporcionales en mi propio paquete icenReg paquete).

Pero por el momento no conozco ningún programa informático para modelos de efectos mixtos para datos censurados por intervalos (que conste que no pretendo estar familiarizado con lo que SAS o Stata dispone) . Si usted realmente quería un modelo paramétrico de efectos mixtos, podría codificar a mano su modelo en algo como Stan o RJags (tengo entendido que ambos tienen una sintaxis que permite la censura por intervalos). Pero yo sugeriría encarecidamente el uso de la ordinal o coxme paquetes.

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