Estoy tratando de mapear espacialmente la supervivencia celular en una imagen escaneada dada de un matraz de células. Antecedentes: las células han recibido una alta dosis de irradiación (protones/rayos X) a través de una rejilla, de modo que algunas regiones quedan cubiertas por la irradiación, mientras que otras no. Después de escanear dichas colonias celulares, las imágenes se introducen en un algoritmo de segmentación (que he desarrollado utilizando Matlab), las coordenadas del centroide ( $c_i = (x_i,y_i)$ ) de cada colonia viable detectada.
He realizado este tipo de evaluación para las "franjas" de la cuadrícula, en las que he contado las colonias dentro de una franja a lo largo de una única dimensión ( $x$ ) y probado para diferentes anchos de banda $\Delta x$ (como se muestra en la figura de la izquierda). Sin embargo, mi problema es con los "agujeros" de la cuadrícula (véase la figura de la derecha): ¿cómo puedo realizar el mismo tipo de evaluación de la supervivencia de las colonias celulares en dos dimensiones ( $x$ y $y$ ) dadas las coordenadas del centroide? ¿Tengo que "pensar" radialmente?
Gracias de antemano por cualquier orientación o ayuda a este problema.
