Puedes calcular fácilmente el ruido térmico (Johnson-Nyquist) del interruptor. Es ruido de banda ancha.
\$v_{n} = \sqrt{ 4 k_B T R \Delta f }\$
donde T es la temperatura en Kelvin, R es la resistencia, \$k_B\$ es la constante de Boltzman, y \$\Delta f\$ es el ancho de banda.
La corriente de fuga podría causar algunas perturbaciones, especialmente en los niveles de CC de la señal. Tendrás que calcularlo a partir de las impedancias del interruptor y del resto del circuito, y de las garantías de corriente de fuga de la hoja de datos.
Para más información, consulte este documento .
Podría haber una ligera tensión en el termopar, pero probablemente insignificante ya que no se calientan, por lo que los gradientes térmicos tienden a ser mínimos.
Los multiplexores CMOS no tienen offset, histéresis, ruido de disparo (excepto un poquito por las fugas del diodo del cuerpo) u otras características malas, sólo fugas y alguna resistencia (no lineal) que puede causar distorsión si no se tiene cuidado, pero como tu pregunta es sobre el ruido ignoraré eso.
En general, el 4052 es mejor de lo que se anuncia en cuanto a fugas, ya que al ser una pieza barata no se ha probado a niveles de fuga muy bajos. Tiene una resistencia interna bastante grande, especialmente cuando se opera a voltajes más bajos.
Se puede obtener un mejor rendimiento garantizado (a un precio) utilizando multiplexores analógicos como los de la serie ADG.