Ahora mismo, no existe una herramienta de transformación vertical personalizada que permita al software saber cómo manejar el archivo geoide local.
Si el archivo geoide está en formato de archivo geoide del Servicio Geodésico Nacional de EE.UU. (US National Geodetic Survey) o en formato de archivo geoide GEOTRANS de la NGA de EE.UU. (US NGA GEOTRANS). También tendría que utilizar ArcGIS Pro, probablemente la versión 2.1 o 2.2. Si ambas cosas son ciertas, hay un método que podría funcionar.
Es posible establecer una variable de entorno del sistema o del usuario y algún archivo de texto para definir una transformación personalizada o sistemas de referencia de coordenadas. Es demasiado complicado para incluirlo aquí, pero envíame un correo electrónico (mkennedy arroba esri punto com) y puedo enviarte documentación.
Divulgación: Trabajo para Esri.