He aquí el análisis de un gran caso. No he calculado cuántos conjuntos de este tipo hay, aunque probablemente no sea muy difícil de averiguar.
Supongamos que $n\geq 100.$ Desde $300>288=8*36$ algún número $i$ es utilizado por al menos nueve de los conjuntos $A_j.$ Podemos suponer que es $1.$ Sea $I$ sea la intersección de todos los conjuntos $A_j$ que no incluyen $1$ (utilizando el hecho de que debe existir al menos un conjunto de este tipo). Ahora dividimos por casos del orden de $I.$
Caso 1. $|I|=3.$
En este caso, hay un único conjunto que no utiliza $1,$ que podemos suponer que es $\{2,3,4\}.$ Todos los demás $A_j$ son de la forma $\{1,x,y\}$ con $x\in\{2,3,4\}.$ Hay tres con $y\in\{2,3,4\}$ y $3*32=96$ con $y\not\in\{2,3,4\},$ más el $\{2,3,4\},$ dando 100 en total.
Caso 2. $|I|=2.$
Podemos suponer que los conjuntos que no incluyen $1$ son precisamente $\{2,3,x\}$ para $x\in \{4,\dots,k\}$ con $k>4.$
Supongamos por ahora que no $A_j$ es igual a $\{1,4,5\}$ (lo que podría ocurrir si $k=5.$ ) Entonces todos los conjuntos que incluyen $1$ debe ser de la forma $\{1,2,y\}$ o $\{1,3,y\}$ para algunos $y,$ porque tienen que intersecar todos los conjuntos $\{2,3,x\}.$ Esto da un conjunto de la forma $\{1,2,3\}$ y $2*33=66$ otros incluyendo 1, y 33 conjuntos sin incluir 1. Es decir, 100 en total.
En el caso especial de que $k=5$ y algunos $A_j$ es igual a $\{1,4,5\},$ hay un conjunto más, pero ninguno de los conjuntos $\{1,2,y\}$ y $\{1,3,y\}$ pueden incluirse. Así que en ese caso apenas hay conjuntos, desde luego mucho menos de 100.
Caso 3. $|I|=1.$
Podemos suponer que todo conjunto que no incluya 1 contiene 2.
El primer subcaso es que dos triples que no incluyan 1 tengan una intersección de orden 1, $\{2,3,4\}$ y $\{2,5,6\}$ digamos. Entonces todo conjunto que contenga a 1 y que no acierte a 2 debe acertar a 3 ó 4 así como a 5 ó 6. Además algún conjunto no contiene 2 por lo que debe ser $\{1,3,5\}$ (intercambiando 3 y 4 si es necesario, y 5 y 6 si es necesario). Si ninguno de los conjuntos $\{1,3,6\},\{1,4,5\},\{1,4,6\}$ están en la familia, hay $34 + 1$ conjuntos que incluyen 1, y 65 que no incluyen 1 porque éstos deben contener 2 y 3 ó 5. Esto da 100. Si uno de los conjuntos $\{1,3,6\},\{1,4,5\},\{1,4,6\}$ está en la familia, entonces hay muchos menos conjuntos que contengan 2, es decir, mucho menos de 100 en total.
El otro subcaso es que todas las tripletas que contengan $2$ tienen una intersección de orden 2. Podemos suponer $\{2,3,4\}$ está en la familia, entonces un conjunto que no contenga 4, digamos $\{2,3,5\},$ y un conjunto que no contenga 3, que debe ser $\{2,4,5\},$ y no hay otros conjuntos que no contengan 1. Entonces no hay suficientes conjuntos que contengan 1: a lo sumo 34 que contengan 1 y 2, y a lo sumo otros tres.
Caso 4. $|I|=0.$
El primer subcaso es que dos triples que no incluyan 1 tengan una intersección de orden 1, $\{2,3,4\}$ y $\{2,5,6\}$ digamos. Hay otro conjunto que no incluye 2, digamos $\{3,5,x\}$ con $x\neq 2.$ Hay entonces a lo sumo siete conjuntos que incluyen 1 - $\{1,2,3\},\{1,2,5\},\{1,2,x\},\{1,3,5\},\{1,3,6\},\{1,4,5\},\{1,4,6\}$ - contradiciendo la suposición de que 1 está en al menos nueve conjuntos.
El otro subcaso es que todas las tripletas que no contengan 1 tengan una intersección de orden 2. Podemos suponer $\{2,3,4\}$ está en la familia, entonces un conjunto que no contenga 4, digamos $\{2,3,5\},$ y un conjunto que no contenga 3, que debe ser $\{2,4,5\},$ y luego $\{3,4,5\}.$ De nuevo, no hay suficientes conjuntos que contengan 1: como máximo $\{1,2,3\},\{1,2,4\},\{1,2,5\},\{1,3,4\},\{1,3,5\},\{1,4,5\}.$