Tu intuición es correcta y físicamente importante, pero un poco más complicada de lo que describes
Cuando decimos que los átomos son eléctricamente neutros, queremos decir que los objetos lejos del átomo no ven un campo eléctrico neto (los átomos son muy pequeños, por lo que incluso si el efecto que imaginas existe, solo será evidente para objetos cerca del átomo).
Pero tu intuición simple es complicada porque los electrones en los átomos no son partículas puntuales existentes en un solo punto en el átomo. Son más como ondas estacionarias distribuidas espacialmente alrededor del núcleo (debido a Heisenberg y la mecánica cuántica). Esto significa que las cosas son mucho más complejas de lo que serían si los electrones fueran simples partículas puntuales girando alrededor del núcleo generando un dipolo eléctrico en movimiento.
Sin embargo, la intuición básica de que el campo general generado por las nubes de electrones que rodean átomos y moléculas no es cero es correcta. Y esto es muy importante en química y para las propiedades físicas de las moléculas.
Los electrones en moléculas asimétricas a menudo se distribuyen de maneras que generan dipolos eléctricos. La simple molécula de cloruro de hidrógeno (a pesar de ser neutral en general), por ejemplo, tiene un fuerte dipolo eléctrico porque el cloro aleja electrones del hidrógeno.
Pero esto probablemente no es lo principal de lo que estabas preguntando. Incluso moléculas neutrales sin dipolos incorporados tienen algunas características en las que la distribución de electrones puede generar campos eléctricos momentáneos. Si bien la imagen simple de un electrón como una partícula puntual girando alrededor de un núcleo no es una buena manera de imaginar esto, incluso la mecánica cuántica tiene que admitir la incertidumbre sobre la posición del electrón en su nube orbital. Esta incertidumbre genera campos eléctricos fluctuantes temporales porque la distribución no compensa precisamente el campo eléctrico del núcleo. La explicación cuántica detallada de esto es bastante complicada, pero la imagen de campos eléctricos fluctuantes captura algunas de la idea de manera intuitiva.
Más importante aún, estos campos fluctuantes son muy importantes en el mundo real. Son la explicación básica de las fuerzas de van der Waals (o, más correctamente, fuerzas de London) entre moléculas y entre átomos. Cuando una molécula tiene un campo fluctuante, puede generar un campo en una molécula vecina que está cerca de ella. Esto genera una fuerza débil que disminuye rápidamente con la distancia entre las moléculas (es proporcional a r-6 donde r es la distancia intermolecular). Para moléculas neutrales sin dipolo incorporado, este es un factor importante en sus propiedades físicas. Gases como N2 nunca se convertirían en líquidos si la fuerza no existiera. Hidrocarburos simples y muchas otras moléculas no polares no se liquefaccionarían a temperatura ambiente sin estas fuerzas. Incluso en muchas moléculas polares, la fuerza de London representa la mayoría de la interacción molécula-molécula (ver wikipedia).
Las fuerzas de London incluso pueden ser importantes a nivel macroscópico: son la fuerza subyacente que permite a los gecos caminar por las paredes.
Entonces, sí, incluso los átomos o moléculas neutrales tienen campos eléctricos fluctuantes debido a la discrepancia entre la "posición" de los electrones y el núcleo. Y estas fluctuaciones son importantes porque generan fuerzas entre átomos y entre moléculas. Estas son muy importantes para determinar las propiedades físicas de muchas sustancias y incluso se pueden ver a escalas macroscópicas.
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Para obtener una descripción más precisa del significado previsto de la frase "ningun campo electrico neto" en este contexto, busca la Ley de Gauss.
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Esta pregunta podría calificar como duplicada de physics.stackexchange.com/q/267371
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Si los dos campos se cancelaran por completo, incluso cerca del átomo o molécula, no habría moléculas polares, no habría enlaces de hidrógeno, no habría ADN, no nosotros. Así que estás equivocado sabiendo que estás equivocado, porque tienes razón.
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Posible duplicado de ¿Hay un campo eléctrico alrededor de los átomos neutros?