La media $\langle E\rangle$ que tienes a la derecha no debe entenderse en el sentido de la mecánica estadística (y, por tanto, como una temperatura).
La función de onda $\psi$ puede ser una combinación lineal de estados $\psi_n$ de energía definida de su molécula. El $\psi_n$ son soluciones de la ecuación de Schrodinger. Por lo tanto, \begin{align} \psi(x,t)&=\sum_i a_i \psi_i(x,t)\, ,\qquad \sum_i \vert a_i\vert^2=1\, , \tag{1} \\ \hat H\psi_i(x,t)&=E_i\psi_i(x,t)\, . \end{align} Con esta función de onda la energía media $$ \langle E\rangle = \sum_i \vert a_i\vert^2 E_i \tag{2} $$ es una media ponderada de las posibles energías de su molécula, con el módulo al cuadrado $\vert a_i\vert^2$ de la amplitud compleja $a_i$ funcionando como peso estadístico. $\psi(x,t)$ dado en (1) es un ejemplo de estado puro.
Por ejemplo, si se tiene una función de onda de hidrógeno de la forma $$ \psi(r)=a_1\psi_{100}(r)+a_2\psi_{200}(r) $$ entonces la energía media de este sistema es $$ \vert a_1\vert^2\times (-13.6) + \vert a_2\vert^2 \times (-13.6/4). \tag{3} $$ Midiendo la energía, a veces se obtiene el valor $-13.6$ (este resultado se producirá $\vert a_1\vert^2$ del tiempo) y a veces se obtiene el valor $-13.6/4$ (este resultado se producirá $\vert a_2\vert^2$ del tiempo). El media La energía viene dada exactamente por (3).
En la mecánica estadística cuántica se introduce el concepto de estado mixto. Para los estados mixtos no se puede definir una función de onda para el sistema como en (1). El sistema se describe mediante una matriz que representa una mezcla estadística de la función de onda que no tiene la forma dada en (1); la energía media para esta mezcla estadística tampoco tiene la forma (2), ya que ésta proviene de (1), que no existe para los estados mezclados.